More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6132 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  60.09 
 
 		 655 aa  778    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  64.38 
 
 		 603 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  66.19 
 
 		 660 aa  855    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  66.18 
 
 		 612 aa  822    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  67.89 
 
 		 626 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  60.23 
 
 		 611 aa  773    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  64.16 
 
 		 602 aa  809    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  66.72 
 
 		 656 aa  845    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  59.46 
 
 		 630 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  60.23 
 
 		 613 aa  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  65.38 
 
 		 659 aa  835    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  59.77 
 
 		 611 aa  770    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  62.14 
 
 		 622 aa  808    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  66.51 
 
 		 660 aa  858    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  61.38 
 
 		 632 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  60.71 
 
 		 660 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  66.5 
 
 		 612 aa  836    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  61.48 
 
 		 625 aa  788    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  60.06 
 
 		 611 aa  771    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  59.11 
 
 		 629 aa  757    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  59.42 
 
 		 625 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  66.35 
 
 		 660 aa  857    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  63.55 
 
 		 634 aa  823    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  95.05 
 
 		 626 aa  1226    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  59.19 
 
 		 630 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  62.06 
 
 		 621 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  61.37 
 
 		 631 aa  827    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  60.48 
 
 		 629 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  59.46 
 
 		 630 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  60.83 
 
 		 629 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  60.74 
 
 		 661 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  60.22 
 
 		 629 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 626 aa  1297    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  61.18 
 
 		 656 aa  746    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  60.35 
 
 		 629 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  59.15 
 
 		 630 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  59.49 
 
 		 630 aa  751    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  67.73 
 
 		 643 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  66.01 
 
 		 612 aa  833    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  61.94 
 
 		 658 aa  796    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  59.08 
 
 		 629 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  60.83 
 
 		 629 aa  760    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  60.22 
 
 		 629 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  60.74 
 
 		 661 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  60.13 
 
 		 629 aa  760    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  60.33 
 
 		 619 aa  779    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  61.38 
 
 		 632 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  66.18 
 
 		 660 aa  842    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  59.97 
 
 		 632 aa  751    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  66.51 
 
 		 660 aa  857    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  59.49 
 
 		 626 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  64.25 
 
 		 629 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  59.9 
 
 		 611 aa  768    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  58.87 
 
 		 625 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  61.22 
 
 		 632 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  58.52 
 
 		 630 aa  751    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  63.4 
 
 		 626 aa  814    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  82.63 
 
 		 626 aa  1054    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  51.46 
 
 		 591 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  61.34 
 
 		 487 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  51.93 
 
 		 595 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  52.98 
 
 		 593 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  46.55 
 
 		 618 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  47.96 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  39.85 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  35 
 
 		 566 aa  292  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  34.81 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  34.81 
 
 		 566 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  34.81 
 
 		 566 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  34.63 
 
 		 566 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.3 
 
 		 557 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.34 
 
 		 545 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.28 
 
 		 546 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.69 
 
 		 556 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 543 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.35 
 
 		 548 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.95 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.96 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.5 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.5 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.07 
 
 		 541 aa  171  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.96 
 
 		 522 aa  171  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.32 
 
 		 522 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.36 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.14 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.78 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 583 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  24.91 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.48 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.14 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.32 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  28.23 
 
 		 543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 579 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.86 
 
 		 560 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4333  putative metallo-dependent hydrolase  28.47 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.86 
 
 		 556 aa  160  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 556 aa  160  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>