More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4811 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  57.91 
 
 
655 aa  738    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  62.56 
 
 
603 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  63.55 
 
 
626 aa  804    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  64.27 
 
 
660 aa  836    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  63.16 
 
 
612 aa  799    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  60.76 
 
 
631 aa  798    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  57.28 
 
 
611 aa  732    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  56.82 
 
 
626 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  65.09 
 
 
629 aa  822    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  57.12 
 
 
613 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  66.72 
 
 
632 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  67.14 
 
 
622 aa  889    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  65.98 
 
 
629 aa  804    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  66.72 
 
 
632 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  64.43 
 
 
612 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  56.8 
 
 
611 aa  723    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  65.29 
 
 
625 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  66.67 
 
 
629 aa  840    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  66.98 
 
 
630 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  56.96 
 
 
611 aa  729    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  65.99 
 
 
625 aa  840    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  56.53 
 
 
611 aa  723    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  65.18 
 
 
660 aa  846    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  100 
 
 
634 aa  1304    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  63.61 
 
 
626 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  65.34 
 
 
630 aa  829    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  64.98 
 
 
629 aa  832    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  67.73 
 
 
621 aa  886    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  65.39 
 
 
658 aa  853    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  64.43 
 
 
660 aa  837    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  65.23 
 
 
656 aa  831    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  65.5 
 
 
660 aa  830    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  66.83 
 
 
625 aa  842    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  65.88 
 
 
629 aa  830    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  66.35 
 
 
629 aa  836    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  62.62 
 
 
626 aa  773    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  66.82 
 
 
630 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  65.19 
 
 
632 aa  827    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  65.47 
 
 
626 aa  837    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  66.19 
 
 
630 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  66.98 
 
 
630 aa  840    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  58.69 
 
 
643 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  65.45 
 
 
612 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  66.03 
 
 
629 aa  834    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  66.56 
 
 
632 aa  844    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  65.88 
 
 
629 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  66.35 
 
 
629 aa  836    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  65.76 
 
 
619 aa  854    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  64.4 
 
 
602 aa  748    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  64.91 
 
 
660 aa  840    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  65.78 
 
 
630 aa  845    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  89.59 
 
 
626 aa  1175    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  64.58 
 
 
656 aa  790    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  64.59 
 
 
660 aa  837    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  65.76 
 
 
659 aa  832    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  52.75 
 
 
591 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  50.7 
 
 
595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  57.34 
 
 
487 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  55.2 
 
 
629 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  55.58 
 
 
661 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  55.58 
 
 
661 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  49.21 
 
 
593 aa  545  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  44.5 
 
 
618 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  50.09 
 
 
546 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  38.48 
 
 
557 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  33.64 
 
 
566 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  33.46 
 
 
566 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  33.46 
 
 
566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  33.46 
 
 
566 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  33.09 
 
 
566 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.1 
 
 
557 aa  211  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
546 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.42 
 
 
549 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.55 
 
 
545 aa  190  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
539 aa  190  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.22 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.49 
 
 
583 aa  170  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.49 
 
 
569 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.01 
 
 
550 aa  161  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.12 
 
 
532 aa  160  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.81 
 
 
522 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.54 
 
 
520 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.25 
 
 
522 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.53 
 
 
583 aa  153  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.77 
 
 
520 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.02 
 
 
560 aa  153  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.64 
 
 
530 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.44 
 
 
522 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  24.63 
 
 
522 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.21 
 
 
522 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.21 
 
 
522 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.42 
 
 
579 aa  150  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.76 
 
 
544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  24.21 
 
 
522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  27.13 
 
 
601 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.45 
 
 
548 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.65 
 
 
542 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.25 
 
 
522 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  23.51 
 
 
522 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  23.7 
 
 
522 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>