More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3389 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  54.79 
 
 		 660 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  54.71 
 
 		 611 aa  636    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  54.71 
 
 		 611 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  55.38 
 
 		 660 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  55.02 
 
 		 660 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  54.71 
 
 		 613 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  53.46 
 
 		 631 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  54.2 
 
 		 622 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  54.59 
 
 		 658 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  54.71 
 
 		 611 aa  636    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  54.96 
 
 		 660 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  65.26 
 
 		 595 aa  817    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 591 aa  1216    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  54.53 
 
 		 611 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  54.13 
 
 		 621 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  53.51 
 
 		 602 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  55.42 
 
 		 655 aa  630  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  54.43 
 
 		 660 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  53.7 
 
 		 603 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  54.64 
 
 		 612 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  54 
 
 		 619 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  52.38 
 
 		 626 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  53.58 
 
 		 612 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  53.01 
 
 		 656 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  52.75 
 
 		 626 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  53.05 
 
 		 659 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  51.46 
 
 		 626 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  52.17 
 
 		 626 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  52.75 
 
 		 612 aa  611  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  52.46 
 
 		 660 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  52.75 
 
 		 634 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  52.41 
 
 		 656 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  48.53 
 
 		 618 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  52.2 
 
 		 626 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  52.61 
 
 		 629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  52.73 
 
 		 629 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  52.65 
 
 		 630 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  52.83 
 
 		 630 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  52.65 
 
 		 630 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  52.57 
 
 		 625 aa  601  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  52.2 
 
 		 625 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  50.87 
 
 		 630 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  51.74 
 
 		 632 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  51.74 
 
 		 632 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  52.65 
 
 		 629 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  52.83 
 
 		 629 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  51.74 
 
 		 632 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  52.83 
 
 		 629 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  52.65 
 
 		 629 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  52.68 
 
 		 630 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  52.83 
 
 		 629 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  52.65 
 
 		 629 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  52.11 
 
 		 625 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  51.93 
 
 		 629 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  51.15 
 
 		 630 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  50.7 
 
 		 593 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  50.61 
 
 		 632 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  48.78 
 
 		 626 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  48.53 
 
 		 643 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  55.1 
 
 		 487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  43.3 
 
 		 629 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  43.27 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  43.27 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  40.83 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  36.76 
 
 		 557 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  33.46 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  33.27 
 
 		 566 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  33.09 
 
 		 566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  32.91 
 
 		 566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  32.91 
 
 		 566 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 549 aa  198  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 545 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.32 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.52 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.39 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 556 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  25.49 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  25.85 
 
 		 530 aa  151  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 547 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.81 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.6 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.6 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.06 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 532 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  23.67 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.73 
 
 		 522 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  23.66 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  23.66 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  24.06 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  23.84 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  25 
 
 		 601 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  25.26 
 
 		 564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.16 
 
 		 556 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.18 
 
 		 604 aa  136  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  26.71 
 
 		 547 aa  136  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>