More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1668 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  77.88 
 
 
632 aa  1039    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  58.36 
 
 
603 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  61.84 
 
 
660 aa  843    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  63.3 
 
 
612 aa  816    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  62.14 
 
 
660 aa  844    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  56.28 
 
 
611 aa  734    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  79.55 
 
 
629 aa  1070    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  62.75 
 
 
602 aa  748    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  57.19 
 
 
626 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  59.49 
 
 
655 aa  757    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  56.28 
 
 
613 aa  734    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  100 
 
 
660 aa  1370    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  71.06 
 
 
622 aa  935    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  75 
 
 
629 aa  984    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  77.88 
 
 
632 aa  1039    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  63.48 
 
 
656 aa  859    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  64.74 
 
 
612 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  75.32 
 
 
629 aa  1006    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  58.38 
 
 
656 aa  761    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  58.32 
 
 
631 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  78.53 
 
 
625 aa  1050    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  79.78 
 
 
625 aa  1061    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  86.24 
 
 
625 aa  1157    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  56.44 
 
 
611 aa  731    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  79.36 
 
 
632 aa  1055    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  65.18 
 
 
634 aa  846    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  60.23 
 
 
626 aa  761    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  77.03 
 
 
630 aa  1036    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  61.99 
 
 
660 aa  842    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  74.48 
 
 
630 aa  998    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  71.59 
 
 
621 aa  944    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  74.96 
 
 
629 aa  980    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  75 
 
 
629 aa  984    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  78.49 
 
 
626 aa  1057    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  67.37 
 
 
658 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  60.71 
 
 
626 aa  768    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  75.2 
 
 
630 aa  986    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  74.8 
 
 
630 aa  988    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  57.02 
 
 
643 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  65.06 
 
 
612 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  60.7 
 
 
626 aa  764    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  75.12 
 
 
629 aa  983    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  75 
 
 
629 aa  984    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  55.96 
 
 
611 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  68.17 
 
 
619 aa  897    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  74.64 
 
 
630 aa  1002    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  75.12 
 
 
629 aa  984    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  81.09 
 
 
629 aa  1061    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  56.12 
 
 
611 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  77.49 
 
 
630 aa  1050    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  64.57 
 
 
626 aa  839    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  62.39 
 
 
660 aa  834    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  63.46 
 
 
659 aa  855    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  61.99 
 
 
660 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  77.88 
 
 
632 aa  1038    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  52.46 
 
 
591 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  51.32 
 
 
595 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  55.62 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  47.81 
 
 
593 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  50.56 
 
 
629 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  50.93 
 
 
661 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  50.93 
 
 
661 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  45.38 
 
 
618 aa  538  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  46.65 
 
 
546 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  36.94 
 
 
557 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  31.43 
 
 
566 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  31.25 
 
 
566 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  31.18 
 
 
566 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  31.07 
 
 
566 aa  263  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  30.88 
 
 
566 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
546 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.84 
 
 
545 aa  207  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.96 
 
 
549 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 
557 aa  201  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.14 
 
 
539 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.25 
 
 
556 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.67 
 
 
564 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.04 
 
 
538 aa  160  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.83 
 
 
584 aa  153  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.29 
 
 
583 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  25.95 
 
 
549 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  24.78 
 
 
564 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
548 aa  144  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.72 
 
 
583 aa  143  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  25.6 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.57 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  25.65 
 
 
543 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  26.9 
 
 
542 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  25.59 
 
 
537 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  26.37 
 
 
535 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.85 
 
 
579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.4 
 
 
550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  26.5 
 
 
553 aa  138  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 
544 aa  137  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.29 
 
 
560 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  27.75 
 
 
569 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  26.77 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.31 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  27.93 
 
 
601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  26.49 
 
 
601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>