More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0321 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  59.84 
 
 
632 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  60.85 
 
 
625 aa  806    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  59.97 
 
 
603 aa  772    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  68.78 
 
 
660 aa  934    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  66.24 
 
 
612 aa  898    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  59.81 
 
 
611 aa  795    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  100 
 
 
631 aa  1319    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  59.78 
 
 
629 aa  789    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  58.32 
 
 
660 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  58.73 
 
 
629 aa  770    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  61.37 
 
 
626 aa  809    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  60.16 
 
 
629 aa  783    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  59.81 
 
 
613 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  58.73 
 
 
626 aa  783    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  60.1 
 
 
630 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  60.35 
 
 
622 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  58.54 
 
 
632 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  59.84 
 
 
632 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  67.35 
 
 
612 aa  915    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  58.69 
 
 
629 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  60.25 
 
 
629 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  60.51 
 
 
611 aa  796    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  59.49 
 
 
611 aa  791    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  58.25 
 
 
625 aa  779    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  60.03 
 
 
655 aa  786    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  60.76 
 
 
634 aa  798    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  62.32 
 
 
626 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  57.1 
 
 
630 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  62.8 
 
 
626 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  53.46 
 
 
591 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  66.56 
 
 
656 aa  910    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  61.15 
 
 
621 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  66.14 
 
 
660 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  59.43 
 
 
625 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  69.1 
 
 
660 aa  935    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  59.01 
 
 
629 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  58.66 
 
 
629 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  68.94 
 
 
660 aa  934    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  60.19 
 
 
611 aa  793    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  59.64 
 
 
626 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  59.62 
 
 
630 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  59.78 
 
 
630 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  59.64 
 
 
643 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  67.35 
 
 
612 aa  911    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  60.1 
 
 
630 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  59.62 
 
 
658 aa  788    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  69.26 
 
 
660 aa  937    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  59.01 
 
 
629 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  58.66 
 
 
629 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  59.46 
 
 
619 aa  801    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  59.84 
 
 
632 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  59.65 
 
 
656 aa  754    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  61.55 
 
 
602 aa  817    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  66.72 
 
 
659 aa  905    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  58.48 
 
 
630 aa  773    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  60.57 
 
 
626 aa  786    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  58.51 
 
 
487 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  51.49 
 
 
595 aa  628  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  52.97 
 
 
629 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  53.53 
 
 
661 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  53.53 
 
 
661 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  50.88 
 
 
593 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  44.03 
 
 
618 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  47.5 
 
 
546 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  36.11 
 
 
557 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  32.9 
 
 
566 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  32.72 
 
 
566 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  32.53 
 
 
566 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  32.53 
 
 
566 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  32.53 
 
 
566 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.22 
 
 
545 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.95 
 
 
546 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.07 
 
 
549 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.88 
 
 
557 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.78 
 
 
556 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.93 
 
 
539 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.15 
 
 
549 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.47 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.75 
 
 
583 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.86 
 
 
530 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.24 
 
 
579 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.34 
 
 
564 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  26.43 
 
 
556 aa  163  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.08 
 
 
522 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.08 
 
 
522 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.14 
 
 
543 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.63 
 
 
522 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.9 
 
 
522 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.14 
 
 
520 aa  160  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.22 
 
 
522 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.5 
 
 
527 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.76 
 
 
522 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.76 
 
 
522 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  26.58 
 
 
522 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.22 
 
 
522 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  27.5 
 
 
537 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.95 
 
 
522 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  26.49 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  25.04 
 
 
564 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.04 
 
 
543 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>