More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0239 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  66.29 
 
 		 603 aa  783    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  80.1 
 
 		 660 aa  1051    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1254    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  59.48 
 
 		 626 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  59.39 
 
 		 611 aa  741    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  63.3 
 
 		 660 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  64.93 
 
 		 656 aa  762    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  65.97 
 
 		 629 aa  797    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  65.6 
 
 		 632 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  66.18 
 
 		 626 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  59.39 
 
 		 613 aa  742    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  62.94 
 
 		 632 aa  791    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  65.91 
 
 		 622 aa  841    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  65.6 
 
 		 632 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  80.59 
 
 		 660 aa  1054    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  81.05 
 
 		 612 aa  1056    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  64.03 
 
 		 629 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  59.39 
 
 		 611 aa  739    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  64.57 
 
 		 630 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  63.71 
 
 		 625 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  63.18 
 
 		 626 aa  801    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  62.34 
 
 		 655 aa  768    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  63.16 
 
 		 634 aa  799    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  65.85 
 
 		 626 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  64.19 
 
 		 630 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  65.75 
 
 		 621 aa  841    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  62.82 
 
 		 625 aa  807    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  63.39 
 
 		 629 aa  795    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  79.71 
 
 		 660 aa  1022    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  63.23 
 
 		 629 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  63.06 
 
 		 629 aa  789    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  65.6 
 
 		 632 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  59.55 
 
 		 611 aa  743    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  80.42 
 
 		 660 aa  1054    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  63.17 
 
 		 625 aa  793    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  68.18 
 
 		 626 aa  826    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  64.09 
 
 		 630 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  64.41 
 
 		 630 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  59.32 
 
 		 643 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  84.48 
 
 		 612 aa  1085    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  65.15 
 
 		 602 aa  794    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  84.15 
 
 		 659 aa  1075    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  80.42 
 
 		 660 aa  1051    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  59.22 
 
 		 611 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  63.23 
 
 		 629 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  66.24 
 
 		 631 aa  898    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  63.06 
 
 		 629 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  62.96 
 
 		 629 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  64.23 
 
 		 619 aa  807    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  64.72 
 
 		 658 aa  802    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  64.25 
 
 		 629 aa  809    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  64.57 
 
 		 630 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  82.19 
 
 		 656 aa  1046    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  64.58 
 
 		 630 aa  814    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  64.08 
 
 		 626 aa  806    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  52.75 
 
 		 591 aa  611  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  57.99 
 
 		 629 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  49.65 
 
 		 595 aa  593  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  58.36 
 
 		 661 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  58.36 
 
 		 661 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  59.15 
 
 		 487 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  52.02 
 
 		 593 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  46.39 
 
 		 618 aa  550  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  50.09 
 
 		 546 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  41.51 
 
 		 557 aa  350  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  36.8 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  36.62 
 
 		 566 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  36.62 
 
 		 566 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  36.03 
 
 		 566 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  36.25 
 
 		 566 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.11 
 
 		 546 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.28 
 
 		 549 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.51 
 
 		 545 aa  200  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 557 aa  193  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 556 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.52 
 
 		 579 aa  178  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.86 
 
 		 532 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.2 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 543 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.12 
 
 		 583 aa  163  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4333  putative metallo-dependent hydrolase  31.12 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.04 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 530 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 601 aa  157  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.96 
 
 		 538 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.66 
 
 		 569 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.15 
 
 		 542 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.26 
 
 		 560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 556 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.18 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.18 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.64 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.01 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.82 
 
 		 522 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.49 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>