More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5305 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  62.84 
 
 		 625 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  66.51 
 
 		 626 aa  842    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  64.54 
 
 		 603 aa  788    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  97.73 
 
 		 660 aa  1346    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  80.42 
 
 		 612 aa  1054    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  63.71 
 
 		 629 aa  809    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  60.29 
 
 		 611 aa  776    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  66.67 
 
 		 602 aa  838    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  80.15 
 
 		 656 aa  1117    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  63.45 
 
 		 630 aa  813    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  60.45 
 
 		 613 aa  778    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  60.29 
 
 		 611 aa  772    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  64.78 
 
 		 622 aa  851    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  60.45 
 
 		 611 aa  779    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  65.06 
 
 		 625 aa  833    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  66.19 
 
 		 632 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  86.46 
 
 		 612 aa  1118    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  60.61 
 
 		 611 aa  777    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  63.55 
 
 		 629 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  60.33 
 
 		 656 aa  773    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  81.67 
 
 		 660 aa  1113    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  63.61 
 
 		 625 aa  812    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  63.29 
 
 		 630 aa  809    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  64.59 
 
 		 634 aa  837    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  66.83 
 
 		 626 aa  842    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  62.42 
 
 		 630 aa  806    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  58.8 
 
 		 626 aa  708    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  68.94 
 
 		 631 aa  934    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  66.02 
 
 		 621 aa  859    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  84.55 
 
 		 659 aa  1169    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  63.61 
 
 		 629 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  66.03 
 
 		 632 aa  837    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  55.02 
 
 		 591 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  63.71 
 
 		 629 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  63.71 
 
 		 629 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  61.27 
 
 		 655 aa  787    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  66.19 
 
 		 632 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  68.02 
 
 		 626 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  100 
 
 		 660 aa  1366    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  98.18 
 
 		 660 aa  1347    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  63.12 
 
 		 630 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  63.45 
 
 		 630 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  62.65 
 
 		 643 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  86.62 
 
 		 612 aa  1122    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  98.18 
 
 		 660 aa  1347    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  64.58 
 
 		 658 aa  823    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  63.71 
 
 		 629 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  63.71 
 
 		 629 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  63.02 
 
 		 626 aa  809    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  64.85 
 
 		 629 aa  801    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  63.09 
 
 		 619 aa  808    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  62.68 
 
 		 632 aa  800    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  61.99 
 
 		 660 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  63.96 
 
 		 630 aa  819    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  64.89 
 
 		 626 aa  837    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  63.38 
 
 		 629 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  60.08 
 
 		 487 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  55.11 
 
 		 593 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  50.17 
 
 		 595 aa  615  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  55.93 
 
 		 629 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  56.3 
 
 		 661 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  56.3 
 
 		 661 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  49.91 
 
 		 618 aa  588  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  49.17 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  39.34 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  34.2 
 
 		 566 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  34.01 
 
 		 566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  34.01 
 
 		 566 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  34.01 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  33.83 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.2 
 
 		 546 aa  233  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.9 
 
 		 549 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 556 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.23 
 
 		 545 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 557 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 579 aa  176  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 543 aa  167  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  26.26 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.85 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.08 
 
 		 544 aa  161  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.23 
 
 		 522 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  26.4 
 
 		 564 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.14 
 
 		 564 aa  160  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.03 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.15 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.18 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.05 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 543 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  26.72 
 
 		 537 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.12 
 
 		 538 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>