More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1871 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  98.94 
 
 		 566 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  99.12 
 
 		 566 aa  1135    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  100 
 
 		 566 aa  1146    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  98.94 
 
 		 566 aa  1135    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  98.23 
 
 		 566 aa  1126    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  35.41 
 
 		 660 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  36.55 
 
 		 612 aa  299  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  34.16 
 
 		 656 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 602 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  35.86 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  34.13 
 
 		 612 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  34.13 
 
 		 659 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  35.53 
 
 		 626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 660 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  34.92 
 
 		 603 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  34.06 
 
 		 626 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  32.66 
 
 		 631 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 626 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  33.16 
 
 		 660 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  33.82 
 
 		 612 aa  280  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  33.82 
 
 		 655 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  33.52 
 
 		 611 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  32.36 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 634 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 613 aa  277  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 611 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  32.22 
 
 		 591 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  33.15 
 
 		 611 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  33.27 
 
 		 611 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 656 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  34.43 
 
 		 630 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  34.37 
 
 		 630 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  34.55 
 
 		 630 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  34.55 
 
 		 630 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  33.76 
 
 		 629 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  34.43 
 
 		 629 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  33.76 
 
 		 629 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  35.1 
 
 		 643 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  33.89 
 
 		 629 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  33.76 
 
 		 629 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 629 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  33.89 
 
 		 629 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  32.96 
 
 		 621 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 658 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  30.88 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  34 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  34 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  34.25 
 
 		 626 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  32.41 
 
 		 625 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  33.82 
 
 		 632 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  32.35 
 
 		 630 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  31.38 
 
 		 625 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 661 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  31.97 
 
 		 626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  32.72 
 
 		 622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  31.78 
 
 		 632 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 619 aa  255  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  34.76 
 
 		 661 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  31.86 
 
 		 625 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  34.19 
 
 		 546 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 629 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  34.06 
 
 		 629 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  32.09 
 
 		 593 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  29.47 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  31.78 
 
 		 630 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  32.34 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 557 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  29.88 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 545 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.18 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 520 aa  160  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.74 
 
 		 549 aa  150  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 579 aa  137  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.42 
 
 		 603 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.84 
 
 		 584 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.88 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 583 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.95 
 
 		 549 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  24.08 
 
 		 564 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.77 
 
 		 556 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.49 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  25.86 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 536 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 536 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 536 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  25.91 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  26.22 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  26.13 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  25.83 
 
 		 606 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  25.21 
 
 		 608 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  24.44 
 
 		 560 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  25.64 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  26.64 
 
 		 580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2582  Amidohydrolase 3  27.21 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>