More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3185 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  89.82 
 
 		 560 aa  1056    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  70.05 
 
 		 576 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  100 
 
 		 560 aa  1163    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  38.88 
 
 		 620 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  38.77 
 
 		 583 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  38.77 
 
 		 583 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  38.62 
 
 		 543 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  37.05 
 
 		 606 aa  349  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  35.55 
 
 		 582 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  33.03 
 
 		 574 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 616 aa  231  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.65 
 
 		 569 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.68 
 
 		 542 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 556 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.1 
 
 		 535 aa  213  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.6 
 
 		 541 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  30.03 
 
 		 608 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  29.9 
 
 		 575 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 613 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.38 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  28.72 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.46 
 
 		 547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 532 aa  197  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  31.09 
 
 		 553 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.35 
 
 		 537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.77 
 
 		 579 aa  189  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 		 550 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 550 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.6 
 
 		 560 aa  186  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.42 
 
 		 553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29 
 
 		 556 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  30.1 
 
 		 580 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 558 aa  182  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.85 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  28.72 
 
 		 564 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.55 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  31.27 
 
 		 574 aa  180  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.45 
 
 		 543 aa  178  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.56 
 
 		 564 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.62 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.98 
 
 		 564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.97 
 
 		 548 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.97 
 
 		 548 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.97 
 
 		 548 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.63 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.79 
 
 		 560 aa  171  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 568 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  29.05 
 
 		 544 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  29.22 
 
 		 580 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 625 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.16 
 
 		 526 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 553 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.51 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.1 
 
 		 580 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.77 
 
 		 565 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 538 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.86 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.44 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 601 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 542 aa  157  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 552 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.49 
 
 		 539 aa  156  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 538 aa  156  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  29.03 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  25.88 
 
 		 541 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.65 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 573 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  26.2 
 
 		 583 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.57 
 
 		 540 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  25.88 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  25.68 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  26.03 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  27.79 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 536 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 536 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 536 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>