More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4036 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  84.11 
 
 		 604 aa  1060    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  100 
 
 		 601 aa  1241    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  52.58 
 
 		 581 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  52.21 
 
 		 587 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  50 
 
 		 585 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  51.62 
 
 		 650 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  52.87 
 
 		 648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  48.15 
 
 		 581 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  43.76 
 
 		 625 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  34.14 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  37.06 
 
 		 592 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  33.27 
 
 		 537 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 		 584 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.87 
 
 		 564 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 536 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 536 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 536 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  30.9 
 
 		 545 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.03 
 
 		 601 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.84 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.66 
 
 		 575 aa  217  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.76 
 
 		 541 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  31.02 
 
 		 543 aa  213  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.23 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.17 
 
 		 564 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 539 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.59 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  29.63 
 
 		 545 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.7 
 
 		 542 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  28.5 
 
 		 555 aa  193  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  29 
 
 		 555 aa  193  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 556 aa  190  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.07 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  30.18 
 
 		 554 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  30.37 
 
 		 547 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 586 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 556 aa  187  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  28.34 
 
 		 537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 589 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 552 aa  185  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  29.61 
 
 		 547 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.36 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.95 
 
 		 560 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  28.6 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  27.99 
 
 		 638 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 590 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  26.78 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  28.32 
 
 		 542 aa  173  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 544 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 		 540 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.08 
 
 		 537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.86 
 
 		 541 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  26.84 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 569 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 548 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.5 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.99 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.83 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.18 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.43 
 
 		 579 aa  157  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 582 aa  156  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  25.09 
 
 		 568 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  27.41 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  27.41 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.63 
 
 		 530 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.57 
 
 		 553 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 606 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  27.72 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  26.91 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  25.5 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.69 
 
 		 548 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  26.79 
 
 		 543 aa  151  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 543 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.65 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.52 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  26.11 
 
 		 613 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 		 527 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 540 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  25.62 
 
 		 608 aa  146  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  24.79 
 
 		 580 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  27.38 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 624 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.66 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.21 
 
 		 603 aa  145  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  25.27 
 
 		 530 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  26.52 
 
 		 620 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 556 aa  144  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 544 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 569 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>