More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1307 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  59.49 
 
 		 603 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  62.96 
 
 		 660 aa  818    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  79.56 
 
 		 632 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  64.57 
 
 		 612 aa  812    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  56.27 
 
 		 611 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  62.96 
 
 		 660 aa  815    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  71.66 
 
 		 658 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  75.64 
 
 		 625 aa  984    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  60.1 
 
 		 631 aa  795    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  56.11 
 
 		 613 aa  723    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  99.68 
 
 		 630 aa  1294    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  71.63 
 
 		 622 aa  941    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  65.7 
 
 		 659 aa  836    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  79.56 
 
 		 632 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  63.93 
 
 		 612 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  74.4 
 
 		 632 aa  981    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  93.49 
 
 		 629 aa  1216    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  100 
 
 		 630 aa  1297    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  61.45 
 
 		 656 aa  751    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  56.27 
 
 		 611 aa  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  77.24 
 
 		 625 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  64.9 
 
 		 660 aa  820    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  66.82 
 
 		 634 aa  847    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  59.24 
 
 		 626 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  79.11 
 
 		 630 aa  1040    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  55.61 
 
 		 611 aa  722    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  78.25 
 
 		 629 aa  1026    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  72.52 
 
 		 621 aa  952    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  56.27 
 
 		 611 aa  724    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  65.22 
 
 		 656 aa  828    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  62.96 
 
 		 660 aa  816    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  91.9 
 
 		 629 aa  1182    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  92.22 
 
 		 629 aa  1185    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  59.49 
 
 		 626 aa  747    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  62.16 
 
 		 626 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  99.21 
 
 		 630 aa  1290    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  99.05 
 
 		 630 aa  1290    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  57.82 
 
 		 643 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  65.7 
 
 		 612 aa  837    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  57.64 
 
 		 626 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  77.8 
 
 		 629 aa  987    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  91.75 
 
 		 629 aa  1181    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  92.06 
 
 		 629 aa  1184    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  92.22 
 
 		 629 aa  1185    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  74.48 
 
 		 660 aa  1000    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  69.39 
 
 		 619 aa  897    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  76.48 
 
 		 625 aa  983    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  76.12 
 
 		 626 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  59.16 
 
 		 602 aa  743    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  79.56 
 
 		 632 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  58.65 
 
 		 655 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  75.79 
 
 		 630 aa  998    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  66.72 
 
 		 626 aa  846    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  91.9 
 
 		 629 aa  1187    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  63.29 
 
 		 660 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  52.65 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  50 
 
 		 595 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  55.8 
 
 		 487 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  48.85 
 
 		 593 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  51.49 
 
 		 629 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  49.44 
 
 		 661 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  49.44 
 
 		 661 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  44.97 
 
 		 618 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  46.55 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  37.36 
 
 		 557 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  35.19 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  34.81 
 
 		 566 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  35 
 
 		 566 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  34.81 
 
 		 566 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  34.63 
 
 		 566 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 546 aa  218  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.29 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.02 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.75 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 541 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 538 aa  160  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 543 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.58 
 
 		 564 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 584 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.18 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 583 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.01 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 579 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  26.98 
 
 		 560 aa  137  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.06 
 
 		 616 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.28 
 
 		 527 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.08 
 
 		 603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.31 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  26.51 
 
 		 543 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.44 
 
 		 539 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  28.34 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.43 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>