More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3767 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  100 
 
 		 544 aa  1113    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  39.85 
 
 		 529 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  34.57 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 564 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  32.41 
 
 		 608 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  33.57 
 
 		 560 aa  264  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 613 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 569 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  33.03 
 
 		 543 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  36.67 
 
 		 574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  32.59 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  32.17 
 
 		 569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  33.08 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  30.93 
 
 		 596 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.85 
 
 		 574 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.12 
 
 		 569 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.31 
 
 		 542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  31.24 
 
 		 616 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.78 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 589 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.27 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 575 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 580 aa  203  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.46 
 
 		 601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  29.09 
 
 		 568 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  27 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  27 
 
 		 563 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 560 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  26.23 
 
 		 582 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.75 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  29.05 
 
 		 560 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 568 aa  163  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  27.19 
 
 		 580 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.93 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  27.27 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.27 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.61 
 
 		 620 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  26.12 
 
 		 585 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 579 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  25.67 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 550 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  24.56 
 
 		 603 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 583 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 583 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  26.62 
 
 		 580 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.03 
 
 		 545 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 538 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  27.39 
 
 		 583 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  27.39 
 
 		 583 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 584 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 		 543 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  27.12 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.88 
 
 		 546 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.42 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  28.98 
 
 		 632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  28.98 
 
 		 632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.02 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.55 
 
 		 560 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  25.82 
 
 		 549 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  26.15 
 
 		 558 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.96 
 
 		 550 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  28.8 
 
 		 632 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.41 
 
 		 564 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.78 
 
 		 583 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  24.77 
 
 		 527 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 556 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.32 
 
 		 557 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  26.21 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  26.42 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.16 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.31 
 
 		 556 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  27.31 
 
 		 556 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 619 aa  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  26.55 
 
 		 612 aa  133  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.05 
 
 		 543 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  23.56 
 
 		 544 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.36 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  25.26 
 
 		 659 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.64 
 
 		 604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.26 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.96 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  34.22 
 
 		 256 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>