More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0803 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  100 
 
 
564 aa  1163    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  34.19 
 
 
539 aa  307  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  32.73 
 
 
543 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  31.69 
 
 
543 aa  266  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  33.94 
 
 
541 aa  263  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  33.69 
 
 
556 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  32.01 
 
 
604 aa  258  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.93 
 
 
548 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.82 
 
 
546 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.86 
 
 
564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  31.55 
 
 
581 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  32.44 
 
 
530 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  32.87 
 
 
601 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  32.01 
 
 
549 aa  250  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.88 
 
 
545 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  32.72 
 
 
539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  32.56 
 
 
543 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.79 
 
 
548 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.54 
 
 
538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.42 
 
 
549 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.6 
 
 
537 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  32.48 
 
 
648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 
584 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.64 
 
 
583 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.02 
 
 
520 aa  230  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  29.43 
 
 
625 aa  226  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.7 
 
 
583 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.49 
 
 
541 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.25 
 
 
616 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  29.66 
 
 
581 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
575 aa  223  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.13 
 
 
575 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  30.71 
 
 
650 aa  220  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.82 
 
 
587 aa  220  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.87 
 
 
537 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.09 
 
 
556 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.6 
 
 
574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.6 
 
 
556 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.88 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.69 
 
 
533 aa  213  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.74 
 
 
530 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.16 
 
 
539 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  30.36 
 
 
601 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.8 
 
 
557 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.78 
 
 
543 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  30.18 
 
 
535 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  29.89 
 
 
563 aa  203  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.6 
 
 
537 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.52 
 
 
573 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.5 
 
 
603 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  28.73 
 
 
536 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  28.73 
 
 
536 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  28.73 
 
 
536 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.69 
 
 
585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.04 
 
 
525 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.31 
 
 
542 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.48 
 
 
522 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.48 
 
 
522 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.79 
 
 
522 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.48 
 
 
522 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.62 
 
 
527 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 
552 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.3 
 
 
522 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  26.11 
 
 
522 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  26.3 
 
 
522 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.11 
 
 
522 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  32.04 
 
 
555 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.06 
 
 
522 aa  193  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.93 
 
 
522 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.92 
 
 
520 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.52 
 
 
579 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 
527 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.07 
 
 
539 aa  190  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.8 
 
 
582 aa  189  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  27.12 
 
 
564 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.45 
 
 
544 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 
544 aa  187  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.27 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.62 
 
 
620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.78 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  29.78 
 
 
547 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  30.04 
 
 
555 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.89 
 
 
541 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.09 
 
 
569 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.87 
 
 
526 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  28.5 
 
 
592 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.84 
 
 
568 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.25 
 
 
576 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  27.56 
 
 
560 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.33 
 
 
562 aa  178  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  27.78 
 
 
540 aa  177  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  30.15 
 
 
522 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  27.66 
 
 
564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.64 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  30.47 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.39 
 
 
547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  27.06 
 
 
557 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 
601 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  27.66 
 
 
547 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.21 
 
 
560 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>