More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1571 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  98.23 
 
 
566 aa  1126    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  100 
 
 
566 aa  1146    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  98.59 
 
 
566 aa  1130    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  98.41 
 
 
566 aa  1128    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  98.59 
 
 
566 aa  1131    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  35.41 
 
 
660 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  35.96 
 
 
602 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  36.36 
 
 
612 aa  298  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  34.16 
 
 
656 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  36.04 
 
 
557 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  35.28 
 
 
603 aa  290  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  35.71 
 
 
626 aa  290  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  34.31 
 
 
659 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  34.31 
 
 
612 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  34.08 
 
 
611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  33.58 
 
 
660 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  34.24 
 
 
626 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  33.89 
 
 
613 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  34.62 
 
 
626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  33.89 
 
 
611 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  34.66 
 
 
626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
660 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  33.71 
 
 
611 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  33.71 
 
 
611 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  34 
 
 
655 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
660 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  33.82 
 
 
612 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  33.76 
 
 
634 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  32.66 
 
 
631 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  33.02 
 
 
660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  32.4 
 
 
591 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  34.73 
 
 
630 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  34.43 
 
 
630 aa  273  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 
656 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  34.43 
 
 
629 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  34.37 
 
 
630 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  34.73 
 
 
630 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  33.89 
 
 
629 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  35.28 
 
 
643 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  33.76 
 
 
629 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  33.94 
 
 
629 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  33.89 
 
 
629 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  33.94 
 
 
629 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  33.89 
 
 
629 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  34.37 
 
 
632 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  34.37 
 
 
632 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  33.15 
 
 
621 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  34.43 
 
 
626 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  33.39 
 
 
658 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  32.9 
 
 
630 aa  264  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  34.19 
 
 
632 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  31.07 
 
 
660 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  32.6 
 
 
625 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  31.56 
 
 
625 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  32.9 
 
 
622 aa  259  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  32.16 
 
 
626 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  34.76 
 
 
661 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  32.48 
 
 
619 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  31.97 
 
 
632 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  29.35 
 
 
618 aa  257  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  34.76 
 
 
661 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  32.04 
 
 
625 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  34.56 
 
 
546 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  32.17 
 
 
629 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  34.38 
 
 
629 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  32.44 
 
 
593 aa  253  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  29.84 
 
 
595 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  32.16 
 
 
630 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  32.53 
 
 
629 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.79 
 
 
557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  29.88 
 
 
487 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.84 
 
 
545 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.96 
 
 
546 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.68 
 
 
539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.28 
 
 
549 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.58 
 
 
520 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  30.28 
 
 
535 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.28 
 
 
532 aa  146  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 
584 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.81 
 
 
579 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 
603 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.97 
 
 
583 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.68 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.61 
 
 
556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.88 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.13 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  25.86 
 
 
553 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  26.66 
 
 
564 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  24.7 
 
 
564 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  25.77 
 
 
536 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  25.77 
 
 
536 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  25.77 
 
 
536 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.08 
 
 
601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  25.55 
 
 
608 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  26.22 
 
 
564 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  25.18 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  25.89 
 
 
576 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.32 
 
 
560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2582  Amidohydrolase 3  27.82 
 
 
566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405161  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  25.67 
 
 
541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>