More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3507 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  61 
 
 		 603 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  62.93 
 
 		 660 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  64.23 
 
 		 612 aa  807    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  60.97 
 
 		 602 aa  762    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  58.77 
 
 		 611 aa  757    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  59.46 
 
 		 631 aa  801    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  63.68 
 
 		 656 aa  783    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  67.95 
 
 		 629 aa  875    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  68.44 
 
 		 629 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  68.17 
 
 		 660 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  58.55 
 
 		 611 aa  754    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  62.94 
 
 		 626 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  58.6 
 
 		 613 aa  756    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  75.45 
 
 		 622 aa  977    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  64.95 
 
 		 659 aa  827    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  67.79 
 
 		 626 aa  882    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  67.68 
 
 		 632 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  63.9 
 
 		 612 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  59.87 
 
 		 655 aa  764    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  69.23 
 
 		 630 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  58.17 
 
 		 626 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  68.54 
 
 		 629 aa  889    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  67.68 
 
 		 632 aa  862    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  65.69 
 
 		 660 aa  830    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  67.1 
 
 		 625 aa  872    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  62.93 
 
 		 660 aa  809    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  65.76 
 
 		 634 aa  854    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  61.14 
 
 		 626 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  68.12 
 
 		 630 aa  872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  69.13 
 
 		 629 aa  857    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  74.51 
 
 		 621 aa  965    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  67.85 
 
 		 632 aa  878    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  68.49 
 
 		 625 aa  887    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  67.68 
 
 		 632 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  68.92 
 
 		 629 aa  870    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  68.7 
 
 		 629 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  63.09 
 
 		 660 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  67.58 
 
 		 625 aa  861    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  60.33 
 
 		 626 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  69.07 
 
 		 630 aa  881    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  68.91 
 
 		 630 aa  874    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  58.17 
 
 		 643 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  64.79 
 
 		 612 aa  828    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  58.28 
 
 		 611 aa  753    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  69.08 
 
 		 629 aa  874    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  68.7 
 
 		 629 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  69.39 
 
 		 630 aa  893    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  100 
 
 		 619 aa  1273    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  77.89 
 
 		 658 aa  978    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  63.25 
 
 		 660 aa  810    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  59.09 
 
 		 611 aa  756    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  65.53 
 
 		 656 aa  839    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  67.2 
 
 		 630 aa  865    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  65.53 
 
 		 626 aa  847    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  68.7 
 
 		 629 aa  872    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  54 
 
 		 591 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  58.67 
 
 		 487 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  51.23 
 
 		 595 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  50.53 
 
 		 593 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  53.73 
 
 		 629 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  54.29 
 
 		 661 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  54.29 
 
 		 661 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  46.6 
 
 		 618 aa  549  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  47.83 
 
 		 546 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  38.4 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  32.84 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  32.66 
 
 		 566 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  32.84 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  32.47 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  32.47 
 
 		 566 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 546 aa  210  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.34 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 557 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 539 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 538 aa  170  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.05 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 530 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.85 
 
 		 553 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.53 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.36 
 
 		 564 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 584 aa  154  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.15 
 
 		 556 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 569 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 543 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.65 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.43 
 
 		 564 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.86 
 
 		 601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 583 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  28.07 
 
 		 576 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.18 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.88 
 
 		 539 aa  144  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 579 aa  141  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 		 541 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.65 
 
 		 560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  26.83 
 
 		 543 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.77 
 
 		 522 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 537 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>