More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 541 aa  1071    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  61.36 
 
 		 548 aa  631  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  51.2 
 
 		 548 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  46.64 
 
 		 543 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  43.54 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  43.33 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  34.14 
 
 		 543 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  33.7 
 
 		 549 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  31.18 
 
 		 539 aa  243  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 546 aa  243  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  35.02 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  33.2 
 
 		 543 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  30.85 
 
 		 564 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 545 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  34.96 
 
 		 527 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 		 532 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 553 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  34.64 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  33.87 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  34.85 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 533 aa  217  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 557 aa  216  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.06 
 
 		 560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  30.77 
 
 		 557 aa  210  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 556 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.3 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.73 
 
 		 565 aa  203  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.3 
 
 		 556 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 583 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  35.48 
 
 		 522 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.75 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.33 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 563 aa  193  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.52 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.31 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  28.06 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.38 
 
 		 522 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  32.93 
 
 		 520 aa  190  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.14 
 
 		 537 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  34.8 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.2 
 
 		 522 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.06 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.32 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.18 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  31.8 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.93 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.93 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 535 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.14 
 
 		 564 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.07 
 
 		 543 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.3 
 
 		 522 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.61 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.03 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.38 
 
 		 544 aa  179  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  31.46 
 
 		 556 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  30.45 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  30.45 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.75 
 
 		 542 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.34 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 554 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.05 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.69 
 
 		 619 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.29 
 
 		 547 aa  170  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.18 
 
 		 583 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.55 
 
 		 560 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 603 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.35 
 
 		 569 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  26.29 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 625 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  33.87 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29 
 
 		 527 aa  163  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.95 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  28.76 
 
 		 564 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  30.92 
 
 		 542 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.55 
 
 		 575 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 542 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  31.56 
 
 		 553 aa  160  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.53 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  29.37 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  28.36 
 
 		 555 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 536 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  29.61 
 
 		 613 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.49 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 608 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  28.43 
 
 		 573 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 585 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.62 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>