More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0192 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  100 
 
 
542 aa  1127    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  53.65 
 
 
531 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  52.73 
 
 
533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.47 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
543 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.07 
 
 
527 aa  193  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  30.1 
 
 
542 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.86 
 
 
532 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.03 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.33 
 
 
542 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.99 
 
 
556 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.83 
 
 
533 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.55 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.21 
 
 
530 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  31.45 
 
 
520 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.49 
 
 
548 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.36 
 
 
552 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.83 
 
 
539 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.46 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.93 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.31 
 
 
557 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.56 
 
 
522 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.75 
 
 
522 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.03 
 
 
537 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  29.28 
 
 
540 aa  161  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.37 
 
 
522 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.37 
 
 
522 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.09 
 
 
574 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
545 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.11 
 
 
549 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 
522 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.36 
 
 
549 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.56 
 
 
569 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.63 
 
 
556 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.68 
 
 
538 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.62 
 
 
546 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.93 
 
 
522 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  25.83 
 
 
603 aa  157  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  30.29 
 
 
512 aa  157  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  28.76 
 
 
535 aa  157  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.97 
 
 
520 aa  157  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.19 
 
 
535 aa  157  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 
616 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.59 
 
 
553 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.16 
 
 
565 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.27 
 
 
619 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.16 
 
 
552 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 
584 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.03 
 
 
544 aa  153  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.56 
 
 
522 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
537 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29 
 
 
548 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.75 
 
 
522 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.56 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.55 
 
 
542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  27.27 
 
 
537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.87 
 
 
583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  27.89 
 
 
538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.1 
 
 
541 aa  148  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  27.21 
 
 
573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  30.24 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.42 
 
 
545 aa  147  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.08 
 
 
575 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.06 
 
 
583 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.76 
 
 
556 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.95 
 
 
557 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.9 
 
 
575 aa  144  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.5 
 
 
543 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  27.98 
 
 
539 aa  143  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 
564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.54 
 
 
560 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  28.12 
 
 
568 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  26.02 
 
 
579 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  27.17 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.08 
 
 
539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
477 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.28 
 
 
525 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.45 
 
 
547 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  26.15 
 
 
544 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.32 
 
 
543 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  27.4 
 
 
543 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  27.8 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.13 
 
 
543 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  24.14 
 
 
527 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.89 
 
 
564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.04 
 
 
539 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
554 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  26.59 
 
 
576 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.29 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  24.39 
 
 
544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  30.67 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26 
 
 
606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.39 
 
 
560 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.25 
 
 
541 aa  127  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  25.55 
 
 
558 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  24.72 
 
 
526 aa  126  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>