More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2408 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  100 
 
 
520 aa  1062    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  79.68 
 
 
512 aa  817    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 
545 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.38 
 
 
543 aa  217  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.87 
 
 
539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  32.86 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.71 
 
 
539 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  31.07 
 
 
543 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 
533 aa  211  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.78 
 
 
583 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.31 
 
 
556 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.86 
 
 
556 aa  203  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.92 
 
 
549 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.07 
 
 
532 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.21 
 
 
546 aa  200  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.65 
 
 
543 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.35 
 
 
546 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.33 
 
 
553 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.05 
 
 
540 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.14 
 
 
548 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.86 
 
 
553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  32.88 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  34.88 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.76 
 
 
548 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.04 
 
 
574 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.94 
 
 
564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.54 
 
 
579 aa  183  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  28.77 
 
 
522 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  28.77 
 
 
522 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
522 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.38 
 
 
530 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.99 
 
 
522 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.05 
 
 
549 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.96 
 
 
522 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.24 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.7 
 
 
522 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.4 
 
 
557 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.82 
 
 
522 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  31.24 
 
 
531 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.96 
 
 
522 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.82 
 
 
522 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
548 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.24 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.81 
 
 
527 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  32.25 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.53 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.71 
 
 
619 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.02 
 
 
560 aa  173  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.21 
 
 
520 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.93 
 
 
550 aa  173  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.33 
 
 
537 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  31.45 
 
 
542 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.06 
 
 
520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.94 
 
 
543 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.26 
 
 
564 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.58 
 
 
565 aa  166  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.81 
 
 
569 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.14 
 
 
557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  28.07 
 
 
530 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.47 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27.61 
 
 
522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.38 
 
 
539 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.98 
 
 
544 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27.54 
 
 
552 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.83 
 
 
539 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  25.63 
 
 
526 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.43 
 
 
556 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.05 
 
 
562 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  28.36 
 
 
505 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  32.77 
 
 
477 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
540 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.71 
 
 
545 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.89 
 
 
569 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  29.03 
 
 
563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  28.33 
 
 
576 aa  156  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  27.51 
 
 
564 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  29.4 
 
 
533 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 
584 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.84 
 
 
536 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.16 
 
 
568 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  26.1 
 
 
560 aa  151  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.96 
 
 
568 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
542 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.89 
 
 
537 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  29.49 
 
 
537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.44 
 
 
553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.62 
 
 
544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.67 
 
 
583 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  32.82 
 
 
536 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.09 
 
 
535 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  25.74 
 
 
573 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.34 
 
 
560 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  25.6 
 
 
543 aa  143  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.09 
 
 
620 aa  143  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.58 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  27.69 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 
547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  24.44 
 
 
596 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>