More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4125 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  100 
 
 
544 aa  1075    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  49.72 
 
 
579 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  41.59 
 
 
553 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  37.7 
 
 
553 aa  325  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  38.09 
 
 
560 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  38.27 
 
 
557 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  40.08 
 
 
556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  33.94 
 
 
544 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  35.65 
 
 
552 aa  309  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  39.04 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  37.21 
 
 
619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  35.66 
 
 
543 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  36.74 
 
 
550 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.33 
 
 
540 aa  296  8e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  37.14 
 
 
548 aa  296  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  38.61 
 
 
565 aa  294  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  43.1 
 
 
536 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  36.23 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  40.75 
 
 
568 aa  274  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  34.78 
 
 
530 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.46 
 
 
527 aa  269  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  42.91 
 
 
536 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  34.34 
 
 
583 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  35.47 
 
 
556 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.06 
 
 
556 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  40.67 
 
 
565 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.23 
 
 
543 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  44.53 
 
 
532 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  38.28 
 
 
554 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  40.73 
 
 
532 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.62 
 
 
574 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  31.34 
 
 
563 aa  224  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  36.73 
 
 
553 aa  223  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.89 
 
 
539 aa  217  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.78 
 
 
522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.18 
 
 
569 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.7 
 
 
535 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 
522 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  30.32 
 
 
520 aa  210  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  30.17 
 
 
522 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  34.38 
 
 
549 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.92 
 
 
522 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.58 
 
 
537 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.04 
 
 
522 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.33 
 
 
603 aa  206  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
589 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.66 
 
 
522 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.66 
 
 
522 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.85 
 
 
522 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.33 
 
 
522 aa  203  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  30.71 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.97 
 
 
555 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  32.31 
 
 
552 aa  200  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.79 
 
 
522 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.09 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  34.2 
 
 
537 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  29.66 
 
 
522 aa  198  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 
533 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  34.21 
 
 
544 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.01 
 
 
539 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.53 
 
 
543 aa  194  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  32.12 
 
 
537 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.14 
 
 
616 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  31.83 
 
 
620 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.46 
 
 
527 aa  189  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.49 
 
 
545 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.11 
 
 
542 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.76 
 
 
546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  32.42 
 
 
548 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  32.42 
 
 
548 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  31.61 
 
 
564 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  32.42 
 
 
548 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.58 
 
 
541 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 
557 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.09 
 
 
541 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.95 
 
 
520 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  34.39 
 
 
548 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.79 
 
 
538 aa  177  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  29.73 
 
 
582 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  29.55 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  31.36 
 
 
601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.71 
 
 
540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.92 
 
 
538 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  30.8 
 
 
648 aa  174  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.18 
 
 
581 aa  174  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.81 
 
 
549 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.9 
 
 
564 aa  173  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.08 
 
 
576 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  32.65 
 
 
501 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  34.32 
 
 
545 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
606 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.16 
 
 
564 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  31.03 
 
 
583 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  31.03 
 
 
583 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  32.35 
 
 
548 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 
543 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.34 
 
 
550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.88 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.9 
 
 
569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>