More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0635 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 
575 aa  1192    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  99.65 
 
 
575 aa  1189    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  50.34 
 
 
584 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  52.57 
 
 
583 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  40.73 
 
 
601 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  34.39 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  34.5 
 
 
536 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  34.5 
 
 
536 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  34.5 
 
 
536 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  33.28 
 
 
618 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  32.1 
 
 
626 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.57 
 
 
581 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  30.2 
 
 
928 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.68 
 
 
538 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  31.07 
 
 
539 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  32.3 
 
 
625 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.6 
 
 
543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.67 
 
 
556 aa  233  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  32.48 
 
 
592 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  30.88 
 
 
554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  30.77 
 
 
543 aa  223  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 
564 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  29.72 
 
 
547 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  29.84 
 
 
601 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.39 
 
 
587 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
606 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  29.19 
 
 
604 aa  213  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  29.68 
 
 
586 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.78 
 
 
552 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  29.17 
 
 
585 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  29.74 
 
 
563 aa  211  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.25 
 
 
581 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  30.28 
 
 
547 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.93 
 
 
590 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.22 
 
 
520 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  29.8 
 
 
547 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.74 
 
 
542 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
545 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.33 
 
 
541 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.11 
 
 
556 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  29.8 
 
 
557 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.55 
 
 
533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  30.43 
 
 
555 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.91 
 
 
620 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.96 
 
 
551 aa  200  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.88 
 
 
574 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.3 
 
 
553 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  30.04 
 
 
539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.55 
 
 
548 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  29.49 
 
 
650 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  29.07 
 
 
542 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  30.22 
 
 
554 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  29.35 
 
 
537 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.32 
 
 
583 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.32 
 
 
583 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.04 
 
 
546 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
556 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.2 
 
 
543 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.9 
 
 
573 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.25 
 
 
530 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  28.52 
 
 
544 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  28.94 
 
 
648 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.33 
 
 
549 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.67 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  28.79 
 
 
505 aa  184  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.65 
 
 
525 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.04 
 
 
543 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.49 
 
 
557 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.76 
 
 
544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.67 
 
 
569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.03 
 
 
530 aa  180  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.84 
 
 
522 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  28.41 
 
 
638 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.52 
 
 
553 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.12 
 
 
527 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  27.53 
 
 
624 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.37 
 
 
564 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.32 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  28.67 
 
 
580 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.76 
 
 
619 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.18 
 
 
569 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.39 
 
 
564 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 
544 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.93 
 
 
556 aa  173  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  28.57 
 
 
576 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.29 
 
 
543 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28.89 
 
 
527 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.57 
 
 
522 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.67 
 
 
603 aa  171  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.39 
 
 
522 aa  171  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.21 
 
 
557 aa  170  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.07 
 
 
522 aa  170  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.95 
 
 
542 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.26 
 
 
522 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27.34 
 
 
522 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  27.32 
 
 
616 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  31.08 
 
 
556 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  28.78 
 
 
522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>