More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3258 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  57.25 
 
 		 557 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  100 
 
 		 548 aa  1128    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  72.63 
 
 		 550 aa  852    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  65.41 
 
 		 619 aa  753    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  67.27 
 
 		 556 aa  778    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  56.2 
 
 		 553 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  50.73 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  49.72 
 
 		 546 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  46.47 
 
 		 560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  45.96 
 
 		 552 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  46.11 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  44.3 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  41.84 
 
 		 568 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  42.53 
 
 		 554 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  40.55 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  40.99 
 
 		 565 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  36.4 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  42.11 
 
 		 536 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  42.53 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  42.37 
 
 		 532 aa  326  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  35.33 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  37.4 
 
 		 532 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  35.33 
 
 		 530 aa  309  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  35.37 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  39.37 
 
 		 522 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  35.98 
 
 		 563 aa  302  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  41.91 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  36.36 
 
 		 527 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.41 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 		 589 aa  289  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  35.86 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  32.27 
 
 		 539 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  37.29 
 
 		 544 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  34.4 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  34.95 
 
 		 569 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  33 
 
 		 533 aa  260  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  33.75 
 
 		 520 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  32.02 
 
 		 522 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.69 
 
 		 522 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  31.48 
 
 		 522 aa  253  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  31.31 
 
 		 522 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  31.28 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.48 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.48 
 
 		 522 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.48 
 
 		 522 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 522 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  31.28 
 
 		 522 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.49 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 542 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.6 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.89 
 
 		 542 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.51 
 
 		 544 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.39 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 539 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.44 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.49 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.17 
 
 		 544 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.74 
 
 		 538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.88 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 537 aa  212  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  31.72 
 
 		 564 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  32.8 
 
 		 573 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  30.52 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.33 
 
 		 547 aa  200  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  33.84 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 538 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.88 
 
 		 620 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 548 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  33.48 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.64 
 
 		 601 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.71 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.23 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  31.96 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 557 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  29.49 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.8 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 582 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.25 
 
 		 583 aa  186  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.74 
 
 		 606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  28.63 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  27.52 
 
 		 550 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.52 
 
 		 550 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 		 543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.48 
 
 		 569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  30.04 
 
 		 583 aa  181  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>