More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2467 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  100 
 
 
475 aa  944    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  66.67 
 
 
477 aa  626  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  43.49 
 
 
501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  35.15 
 
 
527 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.94 
 
 
553 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  35.92 
 
 
522 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.8 
 
 
532 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.39 
 
 
556 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.97 
 
 
556 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  35.73 
 
 
565 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  31.63 
 
 
548 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  31.19 
 
 
550 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  29.07 
 
 
520 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  38.3 
 
 
532 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.07 
 
 
535 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  39.9 
 
 
536 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.07 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.12 
 
 
530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  38.6 
 
 
536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  26.58 
 
 
522 aa  171  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.75 
 
 
522 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  31.6 
 
 
557 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  28.75 
 
 
522 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  28.75 
 
 
522 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.75 
 
 
522 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.34 
 
 
522 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  31.1 
 
 
619 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.43 
 
 
522 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  30.2 
 
 
553 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.13 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.01 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.19 
 
 
522 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.78 
 
 
543 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  32.5 
 
 
551 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  32.81 
 
 
546 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.72 
 
 
560 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  39.19 
 
 
532 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.74 
 
 
537 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.12 
 
 
568 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.18 
 
 
541 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  30.54 
 
 
552 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  31.82 
 
 
538 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.77 
 
 
522 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  31.58 
 
 
569 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.98 
 
 
543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.15 
 
 
573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.76 
 
 
543 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.34 
 
 
552 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.41 
 
 
603 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
544 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  33.1 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.29 
 
 
579 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.27 
 
 
542 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.15 
 
 
537 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  29.29 
 
 
531 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  35.17 
 
 
565 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.17 
 
 
553 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  27.15 
 
 
564 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  32.3 
 
 
512 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.17 
 
 
574 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  29.83 
 
 
520 aa  136  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  27.31 
 
 
576 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.89 
 
 
542 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.88 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  29.41 
 
 
533 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  33.77 
 
 
554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  31.46 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.72 
 
 
564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25 
 
 
533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.22 
 
 
545 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  27.13 
 
 
564 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.95 
 
 
548 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.42 
 
 
545 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.23 
 
 
544 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.09 
 
 
541 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.04 
 
 
543 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.13 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.68 
 
 
548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.61 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 
557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.51 
 
 
544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
583 aa  126  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.01 
 
 
543 aa  126  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.98 
 
 
575 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.98 
 
 
575 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 
584 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.86 
 
 
539 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  29 
 
 
485 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.25 
 
 
541 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.54 
 
 
546 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.77 
 
 
620 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.13 
 
 
544 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.25 
 
 
564 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.76 
 
 
569 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.69 
 
 
542 aa  120  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.35 
 
 
549 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>