More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4051 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  63.06 
 
 		 606 aa  798    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  76.75 
 
 		 543 aa  869    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  100 
 
 		 620 aa  1249    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  76.88 
 
 		 583 aa  873    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  76.88 
 
 		 583 aa  873    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  40.54 
 
 		 582 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  38.63 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  38.88 
 
 		 560 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  39.32 
 
 		 576 aa  359  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.87 
 
 		 574 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  35.42 
 
 		 569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  36.03 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  32.69 
 
 		 603 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.93 
 
 		 542 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 616 aa  261  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  35.8 
 
 		 542 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  35.42 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 		 584 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  30.38 
 
 		 558 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  34.1 
 
 		 537 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  35.41 
 
 		 535 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 564 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.04 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.72 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  32.46 
 
 		 608 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 548 aa  210  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 548 aa  210  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 548 aa  210  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 613 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 538 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  30 
 
 		 553 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32 
 
 		 544 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.44 
 
 		 573 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.32 
 
 		 556 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.09 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.05 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.79 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.88 
 
 		 565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.91 
 
 		 575 aa  200  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.73 
 
 		 575 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  31.73 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.44 
 
 		 530 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  33.04 
 
 		 537 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  33.62 
 
 		 574 aa  197  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  32.73 
 
 		 573 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.88 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.71 
 
 		 619 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.32 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 569 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  31.93 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.66 
 
 		 546 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  32.23 
 
 		 579 aa  194  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  31.45 
 
 		 575 aa  194  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  31.59 
 
 		 569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 589 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.81 
 
 		 527 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.1 
 
 		 601 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.32 
 
 		 522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  32.56 
 
 		 576 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.36 
 
 		 556 aa  184  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 536 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 536 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 536 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  30.21 
 
 		 601 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  28.32 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 552 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.92 
 
 		 583 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 557 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  31.37 
 
 		 580 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 542 aa  180  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.72 
 
 		 543 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  30.11 
 
 		 550 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.54 
 
 		 580 aa  177  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 568 aa  176  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 550 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  28.62 
 
 		 585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  30.69 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.95 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.88 
 
 		 557 aa  174  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 539 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.08 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.3 
 
 		 544 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.23 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.41 
 
 		 560 aa  171  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.38 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.15 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  25.55 
 
 		 526 aa  170  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  29.94 
 
 		 541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 565 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.86 
 
 		 564 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>