More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0751 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  100 
 
 		 575 aa  1174    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  34.57 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  33.51 
 
 		 608 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  35.66 
 
 		 560 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  34.43 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  35.21 
 
 		 564 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 613 aa  273  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  35.5 
 
 		 543 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  34 
 
 		 569 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  35.32 
 
 		 576 aa  260  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  32.91 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.94 
 
 		 542 aa  246  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  32.55 
 
 		 569 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  35.52 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.95 
 
 		 569 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 596 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  32.81 
 
 		 576 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.84 
 
 		 574 aa  230  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 616 aa  223  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  33.45 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  33.16 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  33.64 
 
 		 529 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  31.33 
 
 		 603 aa  213  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  32.13 
 
 		 565 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.53 
 
 		 601 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  29.9 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 544 aa  203  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.49 
 
 		 535 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  33.21 
 
 		 543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 545 aa  200  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.04 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.88 
 
 		 532 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  29.49 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  31.45 
 
 		 620 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 584 aa  189  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.87 
 
 		 553 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.2 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.33 
 
 		 538 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.49 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.48 
 
 		 537 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  28.17 
 
 		 585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.71 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 543 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  32.49 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 547 aa  171  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  28.74 
 
 		 580 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.49 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.53 
 
 		 546 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.17 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  25.97 
 
 		 580 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.54 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.32 
 
 		 555 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 527 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.65 
 
 		 565 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  28.45 
 
 		 580 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.42 
 
 		 548 aa  160  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.83 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  24.86 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.4 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 579 aa  156  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 619 aa  156  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 527 aa  156  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 550 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.95 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  31 
 
 		 553 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  25.6 
 
 		 568 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.22 
 
 		 550 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  26.94 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 564 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 563 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.93 
 
 		 522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.96 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.28 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.05 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.87 
 
 		 522 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.62 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.27 
 
 		 549 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.68 
 
 		 522 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.68 
 
 		 522 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.68 
 
 		 540 aa  145  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 583 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.81 
 
 		 544 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.56 
 
 		 522 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  25.18 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  27.16 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>