More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3243 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  100 
 
 		 573 aa  1170    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  50.52 
 
 		 573 aa  557  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  51.07 
 
 		 564 aa  548  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  47.95 
 
 		 569 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  44.91 
 
 		 576 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  47.01 
 
 		 564 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  44.69 
 
 		 569 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  36.4 
 
 		 608 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  35.97 
 
 		 613 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  40.22 
 
 		 574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  36.81 
 
 		 565 aa  290  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  32.92 
 
 		 560 aa  289  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  32.74 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  35.06 
 
 		 569 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  35.86 
 
 		 542 aa  276  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  36.51 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  33.28 
 
 		 596 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 535 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 544 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  34.38 
 
 		 541 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.4 
 
 		 537 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.46 
 
 		 542 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  35.89 
 
 		 530 aa  237  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 532 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  32.6 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.51 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.51 
 
 		 556 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.4 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.33 
 
 		 574 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.49 
 
 		 564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.38 
 
 		 616 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.88 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 544 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  32.12 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  31.74 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.4 
 
 		 601 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  31.81 
 
 		 546 aa  200  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.42 
 
 		 553 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.61 
 
 		 620 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.39 
 
 		 552 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 584 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 582 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.38 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.18 
 
 		 543 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.91 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.2 
 
 		 580 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 583 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 583 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  28.72 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.72 
 
 		 576 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 548 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 548 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 548 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  31.3 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  28.59 
 
 		 583 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.22 
 
 		 580 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  28.43 
 
 		 583 aa  180  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 545 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  28.34 
 
 		 580 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.42 
 
 		 539 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.97 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  31.46 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.55 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.53 
 
 		 522 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 550 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.74 
 
 		 583 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.79 
 
 		 522 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.06 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.96 
 
 		 522 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.41 
 
 		 522 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.67 
 
 		 575 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.08 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.67 
 
 		 575 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  27.73 
 
 		 585 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 560 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.41 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 625 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  28.7 
 
 		 563 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.23 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.23 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  26.05 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.12 
 
 		 568 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 544 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.05 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 568 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 552 aa  160  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>