More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0715 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  100 
 
 		 564 aa  1141    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  69.06 
 
 		 573 aa  779    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  51.56 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  49.63 
 
 		 569 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  48.88 
 
 		 564 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  48.28 
 
 		 576 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  50.84 
 
 		 569 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  37.74 
 
 		 613 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  38.15 
 
 		 608 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  35.77 
 
 		 560 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  37.8 
 
 		 542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  38.3 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  34.31 
 
 		 543 aa  296  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  35.86 
 
 		 565 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  33.87 
 
 		 569 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  36.61 
 
 		 542 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  34.43 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.35 
 
 		 574 aa  270  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  35.39 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  32.59 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  34.84 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  33.7 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  34.16 
 
 		 616 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  35.09 
 
 		 545 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 532 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  33.8 
 
 		 564 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.1 
 
 		 556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 529 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.95 
 
 		 545 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.08 
 
 		 560 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  33.1 
 
 		 606 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 620 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 589 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.05 
 
 		 556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.28 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  32.39 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 584 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.91 
 
 		 603 aa  212  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 583 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.4 
 
 		 565 aa  211  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  31.72 
 
 		 548 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.53 
 
 		 520 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.65 
 
 		 544 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 543 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.06 
 
 		 549 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.09 
 
 		 576 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.15 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.12 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.62 
 
 		 544 aa  200  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.97 
 
 		 580 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.92 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  28.64 
 
 		 565 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.91 
 
 		 522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.68 
 
 		 522 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 522 aa  196  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.92 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.68 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 568 aa  194  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  27.49 
 
 		 522 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.82 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  29.33 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.12 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.12 
 
 		 522 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.12 
 
 		 522 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  29.01 
 
 		 563 aa  190  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.12 
 
 		 564 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  29.39 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.09 
 
 		 557 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.13 
 
 		 522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.42 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.64 
 
 		 543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 582 aa  183  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.02 
 
 		 539 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.55 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 583 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 543 aa  179  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  30.21 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>