More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1441 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  100 
 
 
583 aa  1201    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  39.66 
 
 
556 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  39.92 
 
 
553 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  37.4 
 
 
556 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  35.34 
 
 
550 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  38.1 
 
 
527 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  37.86 
 
 
565 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  36.29 
 
 
546 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  37.17 
 
 
560 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  36.55 
 
 
543 aa  300  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  36.6 
 
 
557 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  36.03 
 
 
579 aa  297  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  34.76 
 
 
553 aa  293  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  34.29 
 
 
533 aa  293  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.99 
 
 
532 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  35.86 
 
 
548 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  35.69 
 
 
552 aa  287  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  34.04 
 
 
543 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  35.71 
 
 
522 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  34.97 
 
 
556 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  32.49 
 
 
544 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  33.93 
 
 
619 aa  276  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  38.45 
 
 
565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  36.23 
 
 
568 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  30.86 
 
 
522 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.98 
 
 
522 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.42 
 
 
540 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  31.07 
 
 
522 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  34.22 
 
 
530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.86 
 
 
522 aa  266  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.38 
 
 
522 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.5 
 
 
522 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  30.21 
 
 
520 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.8 
 
 
522 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  33.96 
 
 
537 aa  264  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.85 
 
 
574 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.44 
 
 
522 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.19 
 
 
522 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.19 
 
 
522 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.78 
 
 
553 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  31.64 
 
 
539 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  34.27 
 
 
549 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.04 
 
 
543 aa  256  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  34.81 
 
 
536 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.31 
 
 
540 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  34.1 
 
 
544 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  32.54 
 
 
563 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.16 
 
 
543 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  34.57 
 
 
485 aa  244  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.33 
 
 
520 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.86 
 
 
545 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  35.57 
 
 
543 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  35.77 
 
 
536 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.33 
 
 
542 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.15 
 
 
537 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  34.17 
 
 
532 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  30.55 
 
 
526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  35.31 
 
 
554 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.45 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.95 
 
 
541 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.77 
 
 
564 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.65 
 
 
545 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  34.39 
 
 
542 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.51 
 
 
544 aa  231  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.14 
 
 
539 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  32.64 
 
 
549 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.08 
 
 
548 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.92 
 
 
557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  30.7 
 
 
564 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.65 
 
 
535 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.13 
 
 
596 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.85 
 
 
569 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  35.32 
 
 
532 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 
569 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.91 
 
 
576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 
547 aa  213  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  31.75 
 
 
550 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.19 
 
 
564 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  31.75 
 
 
550 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.27 
 
 
564 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 
589 aa  210  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.61 
 
 
548 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  30.44 
 
 
527 aa  208  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.03 
 
 
537 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  30.78 
 
 
520 aa  206  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.97 
 
 
562 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  31.66 
 
 
539 aa  203  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.18 
 
 
555 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  31.87 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.57 
 
 
601 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.5 
 
 
538 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.93 
 
 
552 aa  199  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  29.17 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  29.14 
 
 
549 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.41 
 
 
569 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.39 
 
 
560 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.12 
 
 
583 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.11 
 
 
589 aa  193  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.94 
 
 
538 aa  193  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 
608 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>