More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4693 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  100 
 
 
565 aa  1159    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  42.88 
 
 
585 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  43.86 
 
 
580 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  44.65 
 
 
580 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  38.17 
 
 
583 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  38 
 
 
583 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  34.37 
 
 
542 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  32.82 
 
 
569 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.25 
 
 
542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.5 
 
 
535 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.09 
 
 
553 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.12 
 
 
537 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.11 
 
 
541 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.47 
 
 
556 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.17 
 
 
573 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  30.54 
 
 
589 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
530 aa  204  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.99 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 
601 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.26 
 
 
574 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.71 
 
 
532 aa  200  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.92 
 
 
543 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.64 
 
 
564 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  30.65 
 
 
543 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.66 
 
 
545 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.2 
 
 
576 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
569 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.27 
 
 
556 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.39 
 
 
596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.47 
 
 
522 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  31.23 
 
 
574 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
556 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.89 
 
 
538 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.83 
 
 
565 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.96 
 
 
603 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.05 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  28.13 
 
 
555 aa  173  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  28.65 
 
 
550 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.9 
 
 
548 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.11 
 
 
553 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.79 
 
 
557 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.42 
 
 
564 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  27.45 
 
 
608 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.8 
 
 
553 aa  170  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  27.35 
 
 
613 aa  170  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.02 
 
 
547 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.32 
 
 
620 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.4 
 
 
583 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.4 
 
 
583 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  28.82 
 
 
565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.22 
 
 
564 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.04 
 
 
616 aa  164  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.29 
 
 
544 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.23 
 
 
560 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  29.07 
 
 
536 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.83 
 
 
546 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.32 
 
 
606 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 
544 aa  160  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.64 
 
 
560 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.68 
 
 
522 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.69 
 
 
583 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  27.02 
 
 
560 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.14 
 
 
522 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.49 
 
 
522 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.12 
 
 
540 aa  159  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.72 
 
 
558 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  27.26 
 
 
576 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.49 
 
 
522 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.54 
 
 
550 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.93 
 
 
545 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.93 
 
 
583 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.36 
 
 
522 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.6 
 
 
557 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.49 
 
 
522 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.22 
 
 
544 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  25.87 
 
 
568 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  29.36 
 
 
550 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.49 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.49 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  30.32 
 
 
536 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.45 
 
 
548 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.45 
 
 
548 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.45 
 
 
548 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.45 
 
 
522 aa  154  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.14 
 
 
522 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  28.16 
 
 
573 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  27.89 
 
 
587 aa  153  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.93 
 
 
569 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  27.5 
 
 
601 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.22 
 
 
619 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.24 
 
 
579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.01 
 
 
520 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.7 
 
 
543 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  27.84 
 
 
548 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.42 
 
 
541 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  27.12 
 
 
544 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.91 
 
 
552 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  26.25 
 
 
582 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 
584 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>