More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1013 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 548 aa  1070    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  61.17 
 
 		 541 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  50 
 
 		 548 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  48.35 
 
 		 543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  45.77 
 
 		 543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  46.77 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  36.93 
 
 		 545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  35.03 
 
 		 546 aa  267  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  36.43 
 
 		 549 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  37.25 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  35.87 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 539 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  35.27 
 
 		 541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  34.03 
 
 		 543 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  34.03 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  31.79 
 
 		 564 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  35.88 
 
 		 530 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  36.54 
 
 		 537 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  35.94 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  30.52 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.04 
 
 		 532 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.76 
 
 		 527 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  34.84 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  33.45 
 
 		 584 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.9 
 
 		 546 aa  217  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.85 
 
 		 565 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.07 
 
 		 560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  34.68 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.61 
 
 		 583 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.07 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 556 aa  203  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.67 
 
 		 569 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  35.3 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.88 
 
 		 557 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.55 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.66 
 
 		 575 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  34.07 
 
 		 549 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 556 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  34.8 
 
 		 535 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.07 
 
 		 556 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 530 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.52 
 
 		 563 aa  193  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 537 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.96 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  29.29 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.99 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 587 aa  186  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.5 
 
 		 574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29 
 
 		 583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  32.76 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  32.93 
 
 		 565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.84 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.77 
 
 		 619 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 552 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  30 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  27.12 
 
 		 522 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.55 
 
 		 522 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  28.6 
 
 		 585 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 		 522 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.75 
 
 		 522 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.75 
 
 		 522 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  32.07 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  35.06 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  34.29 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.26 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.6 
 
 		 573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  31.48 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.31 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 536 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 536 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 536 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  28.9 
 
 		 568 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.89 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.25 
 
 		 522 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  28.83 
 
 		 592 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 564 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  29.58 
 
 		 531 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  30.96 
 
 		 533 aa  170  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.2 
 
 		 568 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 569 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.45 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  32.62 
 
 		 537 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.88 
 
 		 522 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  29.96 
 
 		 555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.22 
 
 		 604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  29.52 
 
 		 542 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.18 
 
 		 555 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>