More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0420 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  100 
 
 
581 aa  1194    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  52.58 
 
 
601 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  52.73 
 
 
604 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  46.43 
 
 
585 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  51.93 
 
 
650 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  47.72 
 
 
581 aa  552  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  48.16 
 
 
587 aa  547  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  50.28 
 
 
648 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  43.98 
 
 
625 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  38.31 
 
 
563 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  36.03 
 
 
592 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  33.21 
 
 
545 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  31.55 
 
 
564 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.51 
 
 
584 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.74 
 
 
575 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  32.89 
 
 
601 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.57 
 
 
575 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.64 
 
 
537 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  29.58 
 
 
536 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  29.58 
 
 
536 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  29.58 
 
 
536 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.35 
 
 
583 aa  223  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  32.79 
 
 
545 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.78 
 
 
539 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  30.94 
 
 
555 aa  216  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.47 
 
 
538 aa  209  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.51 
 
 
541 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  30.4 
 
 
543 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  29.81 
 
 
555 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.48 
 
 
574 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  30.88 
 
 
547 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.44 
 
 
542 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  30.95 
 
 
547 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 
545 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 
552 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  29.17 
 
 
547 aa  200  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  30.32 
 
 
554 aa  199  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.64 
 
 
543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.43 
 
 
546 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.08 
 
 
560 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  29.89 
 
 
539 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.13 
 
 
564 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  30.7 
 
 
544 aa  193  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 
553 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  31.54 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.96 
 
 
548 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  29.31 
 
 
554 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.56 
 
 
539 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.09 
 
 
556 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  29.6 
 
 
557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.87 
 
 
549 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.29 
 
 
583 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.6 
 
 
556 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.36 
 
 
520 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.66 
 
 
568 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.42 
 
 
569 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28 
 
 
527 aa  179  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.11 
 
 
590 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.43 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 
537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.55 
 
 
549 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.81 
 
 
548 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.31 
 
 
569 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.8 
 
 
530 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.92 
 
 
557 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.32 
 
 
556 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  30.16 
 
 
535 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  25.98 
 
 
526 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  27.59 
 
 
597 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.01 
 
 
540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.05 
 
 
522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.86 
 
 
533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.22 
 
 
582 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  28.04 
 
 
522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.04 
 
 
589 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.69 
 
 
580 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 
522 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.26 
 
 
541 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.45 
 
 
522 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.62 
 
 
546 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.29 
 
 
537 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.27 
 
 
522 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.27 
 
 
522 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.28 
 
 
564 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  29 
 
 
586 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.97 
 
 
537 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.14 
 
 
603 aa  161  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  27.63 
 
 
601 aa  160  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.63 
 
 
522 aa  160  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.77 
 
 
527 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.75 
 
 
520 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.91 
 
 
522 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.4 
 
 
522 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  27.73 
 
 
618 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.54 
 
 
543 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.55 
 
 
522 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  27.66 
 
 
626 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>