More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2185 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  100 
 
 
563 aa  1172    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  39.56 
 
 
625 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  38.31 
 
 
581 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  34.98 
 
 
581 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  38.71 
 
 
585 aa  353  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  34.14 
 
 
601 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  35.31 
 
 
604 aa  343  7e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  32.99 
 
 
592 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  33.94 
 
 
587 aa  317  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  32.84 
 
 
650 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  34.42 
 
 
648 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  32.6 
 
 
545 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.86 
 
 
539 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  29.96 
 
 
554 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  29.21 
 
 
542 aa  216  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.87 
 
 
575 aa  213  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.74 
 
 
575 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  28.67 
 
 
557 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 
552 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  27.19 
 
 
555 aa  204  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.89 
 
 
564 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  27.98 
 
 
555 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.07 
 
 
583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  28.95 
 
 
547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.08 
 
 
540 aa  196  7e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  29.75 
 
 
547 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.21 
 
 
546 aa  194  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  27.52 
 
 
548 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.12 
 
 
539 aa  193  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.49 
 
 
543 aa  193  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.68 
 
 
543 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  26.39 
 
 
554 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
544 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  26.7 
 
 
549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.85 
 
 
557 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  26.59 
 
 
538 aa  190  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  26.73 
 
 
545 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  27.24 
 
 
601 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.23 
 
 
541 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  29.15 
 
 
547 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.61 
 
 
553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.11 
 
 
539 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.8 
 
 
545 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  26.44 
 
 
553 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  27.61 
 
 
537 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.11 
 
 
544 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.83 
 
 
541 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.64 
 
 
556 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  27.52 
 
 
522 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.06 
 
 
522 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  26.51 
 
 
568 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 
526 aa  176  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  26.08 
 
 
537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.06 
 
 
603 aa  174  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  26.34 
 
 
548 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  26.87 
 
 
536 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  26.87 
 
 
536 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  26.87 
 
 
536 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.72 
 
 
557 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.28 
 
 
527 aa  171  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  26.57 
 
 
556 aa  170  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  26.02 
 
 
564 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.68 
 
 
522 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.92 
 
 
520 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.02 
 
 
560 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.35 
 
 
574 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.11 
 
 
543 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.57 
 
 
522 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 
522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.41 
 
 
583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  26.07 
 
 
549 aa  165  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
522 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.49 
 
 
522 aa  164  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.55 
 
 
543 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  25.89 
 
 
597 aa  163  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.39 
 
 
522 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.94 
 
 
522 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  23.59 
 
 
530 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.29 
 
 
527 aa  161  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.19 
 
 
542 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.72 
 
 
542 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  25.22 
 
 
556 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.74 
 
 
533 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  25.97 
 
 
530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  27.34 
 
 
616 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  24.78 
 
 
624 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.8 
 
 
565 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.19 
 
 
541 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  27.16 
 
 
573 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  27.86 
 
 
590 aa  154  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  26.7 
 
 
589 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.91 
 
 
532 aa  153  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  26.19 
 
 
565 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  24.02 
 
 
537 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.26 
 
 
563 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>