More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4766 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  63.62 
 
 
547 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  100 
 
 
545 aa  1100    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  62.89 
 
 
547 aa  709    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  55.11 
 
 
555 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  55.68 
 
 
555 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  53.33 
 
 
552 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  52.93 
 
 
547 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  51.19 
 
 
554 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  51.64 
 
 
554 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  52.99 
 
 
544 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  50.64 
 
 
557 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  48.7 
 
 
542 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  33.74 
 
 
624 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  33.39 
 
 
577 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  31.73 
 
 
638 aa  232  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  32.79 
 
 
581 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.37 
 
 
584 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  33.39 
 
 
536 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  33.39 
 
 
536 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  33.39 
 
 
536 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  33.52 
 
 
537 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.27 
 
 
575 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.09 
 
 
575 aa  206  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  29.63 
 
 
601 aa  206  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  31.51 
 
 
625 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.71 
 
 
604 aa  203  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  32.37 
 
 
543 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  27.49 
 
 
597 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
538 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.57 
 
 
587 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  29.06 
 
 
592 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.73 
 
 
563 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.44 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.44 
 
 
545 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.43 
 
 
601 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.46 
 
 
548 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  31.14 
 
 
648 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  29.32 
 
 
581 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  30.04 
 
 
650 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.07 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.12 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.22 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.03 
 
 
564 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  33.59 
 
 
525 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.62 
 
 
583 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  31.37 
 
 
530 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.03 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  32.49 
 
 
539 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.7 
 
 
541 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.73 
 
 
556 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  26.02 
 
 
576 aa  160  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  30.49 
 
 
586 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  29.84 
 
 
543 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
583 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
583 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  30.87 
 
 
569 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  27.53 
 
 
585 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
556 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.95 
 
 
539 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.7 
 
 
620 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.24 
 
 
606 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.34 
 
 
537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.54 
 
 
553 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.04 
 
 
549 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.13 
 
 
532 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.88 
 
 
541 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  30.04 
 
 
556 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  24.14 
 
 
526 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.64 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.54 
 
 
505 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  26.43 
 
 
618 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.62 
 
 
537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  29.62 
 
 
539 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.95 
 
 
543 aa  137  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  26.47 
 
 
626 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.86 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.8 
 
 
522 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.52 
 
 
527 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  30.58 
 
 
535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.53 
 
 
574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.89 
 
 
527 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.8 
 
 
564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.95 
 
 
543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.7 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26 
 
 
562 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.6 
 
 
583 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.88 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.15 
 
 
589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  26.72 
 
 
545 aa  127  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.81 
 
 
557 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.62 
 
 
603 aa  127  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.49 
 
 
541 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  30.12 
 
 
542 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.9 
 
 
616 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  29.85 
 
 
537 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.48 
 
 
569 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.8 
 
 
522 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.59 
 
 
544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>