More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4035 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 556 aa  1127    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  41.15 
 
 		 538 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  40 
 
 		 539 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  38.95 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 583 aa  259  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  33.69 
 
 		 564 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.13 
 
 		 539 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  33.98 
 
 		 543 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.81 
 
 		 543 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 		 584 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  33.01 
 
 		 541 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.67 
 
 		 575 aa  233  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.48 
 
 		 575 aa  232  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.25 
 
 		 553 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  34.84 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  34.31 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  32.61 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.74 
 
 		 549 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  32.92 
 
 		 601 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  32.38 
 
 		 537 aa  206  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.15 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 527 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.59 
 
 		 542 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.98 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  32.8 
 
 		 569 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  28.73 
 
 		 604 aa  193  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.09 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 586 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 601 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  32.67 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  30.86 
 
 		 530 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  32.08 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.68 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  30.38 
 
 		 648 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.82 
 
 		 556 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.58 
 
 		 565 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  26.97 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 557 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 520 aa  178  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 592 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 545 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.23 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.14 
 
 		 522 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 533 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 532 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.57 
 
 		 563 aa  170  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 650 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.31 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 625 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.86 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 579 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.1 
 
 		 541 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 545 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.18 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  30.71 
 
 		 547 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 522 aa  160  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 554 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.05 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 620 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  29.61 
 
 		 555 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  31.15 
 
 		 539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 619 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.63 
 
 		 585 aa  157  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 		 543 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.81 
 
 		 544 aa  157  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 557 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 556 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.85 
 
 		 543 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 560 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.6 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.26 
 
 		 564 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.19 
 
 		 596 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 542 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 554 aa  150  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>