More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5757 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  71.27 
 
 
555 aa  785    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  100 
 
 
547 aa  1108    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  71.09 
 
 
555 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  76.2 
 
 
554 aa  830    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  70.61 
 
 
552 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  54.25 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  52.09 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  52.93 
 
 
545 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  51.82 
 
 
547 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  52.92 
 
 
547 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  52.41 
 
 
544 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  50.84 
 
 
542 aa  528  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  32.45 
 
 
577 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  34.64 
 
 
624 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 
584 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.91 
 
 
575 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.72 
 
 
575 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  29.87 
 
 
638 aa  216  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  31.94 
 
 
536 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  31.94 
 
 
536 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  31.94 
 
 
536 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.17 
 
 
581 aa  200  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.1 
 
 
583 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  28.95 
 
 
563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  30.49 
 
 
625 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.3 
 
 
538 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  30.22 
 
 
601 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  31.44 
 
 
648 aa  187  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  31.09 
 
 
537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.78 
 
 
564 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  26.68 
 
 
597 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  28.6 
 
 
601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  28.33 
 
 
604 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
650 aa  173  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 
587 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  29.93 
 
 
540 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.64 
 
 
520 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.96 
 
 
545 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  31.23 
 
 
537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  32.28 
 
 
525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.45 
 
 
533 aa  165  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.89 
 
 
542 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.01 
 
 
581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  24.5 
 
 
576 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.19 
 
 
541 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.71 
 
 
556 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  31.1 
 
 
586 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.28 
 
 
543 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.94 
 
 
539 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.55 
 
 
548 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.33 
 
 
553 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.37 
 
 
539 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  28.19 
 
 
592 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.36 
 
 
530 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.62 
 
 
549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.44 
 
 
620 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.22 
 
 
541 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.01 
 
 
606 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  28.01 
 
 
618 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.11 
 
 
574 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.07 
 
 
583 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  31.08 
 
 
569 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.07 
 
 
583 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 
543 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.18 
 
 
589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.03 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.43 
 
 
530 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25 
 
 
557 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  31.62 
 
 
556 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.45 
 
 
546 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
543 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.29 
 
 
564 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.01 
 
 
549 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.51 
 
 
596 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.62 
 
 
543 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  25.74 
 
 
585 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 
603 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.09 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.4 
 
 
522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.78 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.73 
 
 
569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.05 
 
 
569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  30.95 
 
 
590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.73 
 
 
550 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.93 
 
 
551 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
556 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.06 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  25.72 
 
 
616 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  24.73 
 
 
626 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.6 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.89 
 
 
556 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 
562 aa  127  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.84 
 
 
563 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 
558 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  26.06 
 
 
569 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.83 
 
 
550 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.87 
 
 
583 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  23.37 
 
 
526 aa  125  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 
539 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>