More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3318 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  71.9 
 
 		 606 aa  813    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  99.82 
 
 		 583 aa  1094    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 543 aa  1093    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  76.75 
 
 		 620 aa  865    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  99.82 
 
 		 583 aa  1094    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  41.14 
 
 		 582 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  38.62 
 
 		 560 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  38 
 
 		 560 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  38.25 
 
 		 576 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.08 
 
 		 574 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  34.75 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.01 
 
 		 542 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  32.75 
 
 		 603 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  35.51 
 
 		 541 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.15 
 
 		 616 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  35.9 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  35.85 
 
 		 545 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 532 aa  220  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  33.83 
 
 		 553 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.63 
 
 		 537 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  31.65 
 
 		 613 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  31.28 
 
 		 608 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  31.17 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.14 
 
 		 584 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.88 
 
 		 573 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.73 
 
 		 535 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 575 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  32.73 
 
 		 569 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.46 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.61 
 
 		 530 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.58 
 
 		 538 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.89 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 553 aa  193  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.2 
 
 		 575 aa  191  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.02 
 
 		 575 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  33.21 
 
 		 574 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.82 
 
 		 543 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.74 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 553 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 556 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.58 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 		 557 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  31 
 
 		 580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  30.53 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  27.92 
 
 		 585 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.92 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.47 
 
 		 556 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 548 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 548 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.78 
 
 		 538 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 548 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 544 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  32.14 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.83 
 
 		 601 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.66 
 
 		 546 aa  180  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.94 
 
 		 522 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  28.77 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.68 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.73 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.5 
 
 		 544 aa  178  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  30.59 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.15 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 545 aa  177  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.4 
 
 		 564 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 546 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.63 
 
 		 580 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 590 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 580 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.41 
 
 		 544 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  31.74 
 
 		 556 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 529 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  28.81 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.44 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.67 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.06 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.55 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.46 
 
 		 568 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.88 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27.61 
 
 		 581 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  31.94 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 568 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>