More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6052 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  100 
 
 
555 aa  1120    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  75 
 
 
552 aa  845    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  71.27 
 
 
547 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  88.65 
 
 
555 aa  1010    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  72.41 
 
 
554 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  57.55 
 
 
554 aa  628  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  56.58 
 
 
557 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  53.9 
 
 
547 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  55.17 
 
 
542 aa  589  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  55.11 
 
 
545 aa  588  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  53.55 
 
 
547 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  53.33 
 
 
544 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  34.1 
 
 
577 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  33.98 
 
 
624 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 
638 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  32.67 
 
 
536 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  32.67 
 
 
536 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  32.67 
 
 
536 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  33.94 
 
 
584 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.81 
 
 
575 aa  220  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.63 
 
 
575 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.94 
 
 
581 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  32.34 
 
 
601 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.94 
 
 
583 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.5 
 
 
563 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  27.52 
 
 
597 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  28.8 
 
 
604 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
538 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.04 
 
 
564 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  30.98 
 
 
537 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  29.03 
 
 
601 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  31.25 
 
 
625 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.91 
 
 
539 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  30.6 
 
 
587 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  32.12 
 
 
586 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.03 
 
 
549 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  32.54 
 
 
525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  29.14 
 
 
581 aa  174  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  30.07 
 
 
650 aa  173  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.58 
 
 
539 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  29.36 
 
 
648 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.32 
 
 
548 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  26.3 
 
 
576 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  32.24 
 
 
537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.96 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.43 
 
 
592 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  25.87 
 
 
585 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.77 
 
 
540 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.19 
 
 
556 aa  156  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.93 
 
 
548 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.72 
 
 
543 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.32 
 
 
553 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  29.73 
 
 
569 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.4 
 
 
583 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.4 
 
 
583 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 
543 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.29 
 
 
542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.74 
 
 
574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.33 
 
 
541 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.4 
 
 
589 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.2 
 
 
620 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.56 
 
 
533 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29 
 
 
530 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  25.64 
 
 
618 aa  145  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.19 
 
 
539 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.04 
 
 
606 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  30.2 
 
 
556 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.43 
 
 
537 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
545 aa  140  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.9 
 
 
543 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.22 
 
 
539 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.78 
 
 
562 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.07 
 
 
569 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.25 
 
 
590 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  25.37 
 
 
626 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.72 
 
 
546 aa  134  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
583 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.86 
 
 
527 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  25.78 
 
 
596 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.87 
 
 
550 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  30.05 
 
 
550 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.86 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.4 
 
 
541 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.33 
 
 
543 aa  131  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.4 
 
 
603 aa  130  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
552 aa  130  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  26.3 
 
 
558 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  27.52 
 
 
532 aa  130  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.19 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.32 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.56 
 
 
556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  28.88 
 
 
547 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.75 
 
 
564 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 
549 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  28.06 
 
 
537 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
542 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.67 
 
 
522 aa  125  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.36 
 
 
616 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  23.59 
 
 
569 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>