More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2609 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  100 
 
 
548 aa  1087    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  75.32 
 
 
543 aa  818    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  50 
 
 
548 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  51.2 
 
 
541 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  44.3 
 
 
543 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  42.44 
 
 
525 aa  344  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  38.22 
 
 
553 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  31.75 
 
 
539 aa  281  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  34.67 
 
 
539 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  34.15 
 
 
543 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  33.88 
 
 
549 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.52 
 
 
545 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  35.21 
 
 
541 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  33.86 
 
 
543 aa  259  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 
564 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  33.15 
 
 
546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.87 
 
 
538 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  35.26 
 
 
527 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  36.67 
 
 
549 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  34.49 
 
 
530 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  33.4 
 
 
583 aa  233  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  34.9 
 
 
530 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  31.6 
 
 
557 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  36.77 
 
 
537 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.27 
 
 
556 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.21 
 
 
532 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.52 
 
 
556 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  30.05 
 
 
520 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.85 
 
 
557 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.6 
 
 
560 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  33.87 
 
 
556 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  33.39 
 
 
539 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 
537 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.09 
 
 
522 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.45 
 
 
522 aa  210  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  32.01 
 
 
583 aa  210  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.09 
 
 
522 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.09 
 
 
522 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.73 
 
 
522 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.55 
 
 
520 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.07 
 
 
553 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.64 
 
 
546 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.36 
 
 
522 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  33.89 
 
 
522 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.61 
 
 
565 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  34.53 
 
 
542 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.02 
 
 
522 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.65 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.7 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.75 
 
 
550 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.13 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  33.68 
 
 
564 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.39 
 
 
543 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.02 
 
 
522 aa  200  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  35.78 
 
 
540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.73 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  35.51 
 
 
512 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.5 
 
 
548 aa  198  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 
520 aa  197  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.2 
 
 
537 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.08 
 
 
574 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.16 
 
 
552 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.28 
 
 
584 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.73 
 
 
527 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.6 
 
 
619 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  32.11 
 
 
547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  31.25 
 
 
545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.42 
 
 
544 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  31.24 
 
 
533 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 
569 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  34.33 
 
 
554 aa  182  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.59 
 
 
568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.11 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.48 
 
 
575 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.82 
 
 
616 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.48 
 
 
575 aa  178  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.81 
 
 
581 aa  177  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 
543 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  33.03 
 
 
535 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  31.27 
 
 
650 aa  176  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.66 
 
 
603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.43 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.44 
 
 
535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  30.77 
 
 
542 aa  174  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  29.45 
 
 
601 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  29.29 
 
 
604 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.27 
 
 
568 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.76 
 
 
536 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  31.46 
 
 
547 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  29.08 
 
 
531 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
538 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  29.07 
 
 
522 aa  170  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.86 
 
 
560 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  28.99 
 
 
626 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.44 
 
 
545 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.2 
 
 
579 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  30.82 
 
 
555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.97 
 
 
537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  30.88 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  30.94 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>