More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3154 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  100 
 
 		 585 aa  1195    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  66.3 
 
 		 580 aa  780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  64.72 
 
 		 580 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  50.17 
 
 		 583 aa  591  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  50 
 
 		 583 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  42.88 
 
 		 565 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.91 
 
 		 542 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  33.86 
 
 		 569 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  31.31 
 
 		 541 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.21 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.17 
 
 		 553 aa  236  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.74 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 613 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.89 
 
 		 608 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  31.24 
 
 		 574 aa  223  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.17 
 
 		 545 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  30.09 
 
 		 542 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.77 
 
 		 576 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 556 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  31.6 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 565 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.68 
 
 		 530 aa  204  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.05 
 
 		 589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.82 
 
 		 565 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  31.36 
 
 		 543 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 616 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 544 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 532 aa  190  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 569 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.77 
 
 		 538 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.13 
 
 		 583 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.13 
 
 		 583 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.46 
 
 		 558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 564 aa  183  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.03 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.6 
 
 		 560 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.63 
 
 		 548 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.63 
 
 		 548 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.63 
 
 		 548 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.01 
 
 		 543 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.74 
 
 		 619 aa  176  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.99 
 
 		 544 aa  176  9e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 569 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 550 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  28.17 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  25.8 
 
 		 596 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.42 
 
 		 550 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 603 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 583 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.51 
 
 		 555 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.05 
 
 		 543 aa  170  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.25 
 
 		 550 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 573 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.74 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.39 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.09 
 
 		 552 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.07 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.12 
 
 		 544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 541 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  26.59 
 
 		 563 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.08 
 
 		 548 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.15 
 
 		 560 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  26.12 
 
 		 544 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.21 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.84 
 
 		 564 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  28.68 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 583 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 560 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  24.3 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 536 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  28.33 
 
 		 547 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  25.42 
 
 		 563 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.96 
 
 		 540 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.69 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.18 
 
 		 568 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  23 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.34 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  25.09 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  24.78 
 
 		 580 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  23 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>