More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04180 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1216    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  39.46 
 
 
553 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  34.55 
 
 
548 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  34.44 
 
 
556 aa  289  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.19 
 
 
560 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  34.64 
 
 
550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  35.27 
 
 
553 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  34.09 
 
 
557 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  33.06 
 
 
546 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.15 
 
 
565 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  32.39 
 
 
619 aa  256  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  32.32 
 
 
544 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  30.49 
 
 
552 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  32.08 
 
 
543 aa  227  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.02 
 
 
540 aa  227  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  32.37 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.88 
 
 
532 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.17 
 
 
556 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.68 
 
 
568 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.23 
 
 
543 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.47 
 
 
583 aa  210  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  33.26 
 
 
532 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  33.26 
 
 
554 aa  207  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  34.44 
 
 
565 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.21 
 
 
530 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  28.73 
 
 
522 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  29.4 
 
 
522 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.92 
 
 
522 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.92 
 
 
522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.71 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  28.92 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  28.92 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  32.03 
 
 
536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.7 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.08 
 
 
544 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  29.74 
 
 
539 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.93 
 
 
527 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.17 
 
 
522 aa  194  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.66 
 
 
522 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.87 
 
 
522 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27.8 
 
 
522 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  32.92 
 
 
536 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29 
 
 
535 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.19 
 
 
574 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.51 
 
 
553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
548 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
548 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
548 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.35 
 
 
539 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.63 
 
 
542 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.49 
 
 
540 aa  150  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.19 
 
 
544 aa  150  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.49 
 
 
545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.23 
 
 
537 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.22 
 
 
533 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.77 
 
 
569 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  26.58 
 
 
552 aa  140  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  27.09 
 
 
544 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  42.65 
 
 
532 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.63 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  26.2 
 
 
547 aa  133  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.57 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.11 
 
 
537 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  25.64 
 
 
603 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.47 
 
 
542 aa  130  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.18 
 
 
551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.07 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  26.12 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.25 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  25.47 
 
 
537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  26.53 
 
 
548 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  24.91 
 
 
564 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  24.55 
 
 
581 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  27.14 
 
 
547 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  24.74 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  33.98 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  24.9 
 
 
555 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  25.05 
 
 
546 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  24.91 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  25.2 
 
 
564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  25.49 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  24.54 
 
 
585 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  26.79 
 
 
545 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  32.62 
 
 
548 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  25.09 
 
 
580 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
549 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  26.35 
 
 
556 aa  114  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  26.17 
 
 
477 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  28.17 
 
 
499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  26.2 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  25.18 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  26.34 
 
 
492 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  25 
 
 
541 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  24.63 
 
 
538 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 
535 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  24.39 
 
 
583 aa  110  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
501 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  27.31 
 
 
556 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>