More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0778 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  100 
 
 
499 aa  992    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.46 
 
 
533 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.38 
 
 
553 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.14 
 
 
522 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  34.03 
 
 
537 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.78 
 
 
522 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.34 
 
 
522 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  32.67 
 
 
520 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  30.45 
 
 
522 aa  206  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  30.77 
 
 
522 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  30.56 
 
 
522 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.19 
 
 
522 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  30.56 
 
 
522 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.26 
 
 
530 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  30.56 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.74 
 
 
522 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.08 
 
 
583 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  30.88 
 
 
543 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.04 
 
 
579 aa  186  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.5 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.97 
 
 
539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.23 
 
 
560 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.04 
 
 
565 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.46 
 
 
543 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  30.97 
 
 
548 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.75 
 
 
553 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.39 
 
 
532 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.91 
 
 
557 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.39 
 
 
544 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.98 
 
 
546 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.76 
 
 
550 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.49 
 
 
540 aa  169  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.48 
 
 
539 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  31.15 
 
 
527 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  30.09 
 
 
543 aa  166  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.78 
 
 
526 aa  164  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  30.41 
 
 
543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.88 
 
 
536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.21 
 
 
556 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  34.27 
 
 
536 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.79 
 
 
565 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.57 
 
 
619 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.23 
 
 
544 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.8 
 
 
541 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.15 
 
 
548 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.06 
 
 
537 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  24.49 
 
 
556 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 
539 aa  150  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  30.82 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.9 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.35 
 
 
552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.48 
 
 
557 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  30.69 
 
 
532 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.88 
 
 
539 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 
520 aa  143  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.18 
 
 
538 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.77 
 
 
563 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  31.03 
 
 
512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.86 
 
 
569 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  31.18 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  29.21 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.04 
 
 
522 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  28.04 
 
 
435 aa  133  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.46 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.86 
 
 
562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  30.2 
 
 
543 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  27.92 
 
 
540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.39 
 
 
573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  27.14 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  28.9 
 
 
563 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  30 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28.67 
 
 
527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.26 
 
 
569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  33.08 
 
 
508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.85 
 
 
548 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  28.63 
 
 
551 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.92 
 
 
583 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.33 
 
 
541 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.7 
 
 
506 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.38 
 
 
537 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  25.78 
 
 
545 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.79 
 
 
542 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  28.51 
 
 
558 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  30.66 
 
 
501 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  32.64 
 
 
485 aa  124  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  30.3 
 
 
546 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  28.77 
 
 
548 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.4 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  26.65 
 
 
584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  28.37 
 
 
484 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0247  amidohydrolase 3  28.1 
 
 
429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0227591  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.14 
 
 
575 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.48 
 
 
522 aa  120  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  31.17 
 
 
536 aa  120  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.14 
 
 
575 aa  120  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>