234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1596 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  100 
 
 		 436 aa  880    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  46.62 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  41.32 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  41.32 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.66 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.06 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.26 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.58 
 
 		 522 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.37 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.84 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.33 
 
 		 522 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.87 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  25.67 
 
 		 553 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.79 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.19 
 
 		 533 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.69 
 
 		 520 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0247  amidohydrolase 3  28.53 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0227591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.03 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  23.14 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.47 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  25.34 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.52 
 
 		 506 aa  110  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 544 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.82 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.25 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  25.31 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  26.5 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  23.36 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  24.49 
 
 		 546 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.47 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  21.75 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  24.52 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  25.2 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  23.74 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  22.59 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  23.6 
 
 		 541 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  25.77 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  24.88 
 
 		 581 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  23.58 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.86 
 
 		 550 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  24.81 
 
 		 508 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  23.57 
 
 		 543 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  32.18 
 
 		 484 aa  96.7  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  24.7 
 
 		 540 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  22.75 
 
 		 619 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  23.23 
 
 		 565 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.46 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 512 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  23.09 
 
 		 530 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24 
 
 		 504 aa  93.6  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.87 
 
 		 574 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  23.62 
 
 		 553 aa  93.2  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  25.62 
 
 		 527 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  22.49 
 
 		 537 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  22.98 
 
 		 542 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  24.33 
 
 		 562 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  23.11 
 
 		 505 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  23.56 
 
 		 554 aa  90.1  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  22.27 
 
 		 556 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  24.57 
 
 		 581 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  22.64 
 
 		 518 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 		 513 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  21.22 
 
 		 552 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  23.6 
 
 		 539 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  23.96 
 
 		 556 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  22.52 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  22.9 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  23.52 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  22.65 
 
 		 579 aa  87  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.2 
 
 		 522 aa  86.7  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  23.8 
 
 		 585 aa  86.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  23.27 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  30.19 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  23.95 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  24.85 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.98 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  24.6 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  22.9 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  23.18 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  24.09 
 
 		 603 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  28.91 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  23.84 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  23.56 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  28.12 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  23.22 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  23.45 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  22.75 
 
 		 555 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  23.72 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  22.36 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  20.81 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  20.64 
 
 		 563 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  28.51 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  21.97 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  23.68 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  20.73 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>