More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1660 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  100 
 
 		 435 aa  893    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  46.62 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  41.91 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  41.91 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0247  amidohydrolase 3  33.14 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0227591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 539 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.23 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  27.75 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.26 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.26 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.47 
 
 		 522 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.55 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.35 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.99 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.21 
 
 		 522 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.21 
 
 		 522 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  23.37 
 
 		 553 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  23.98 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  23.71 
 
 		 556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  26.16 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  24.13 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.68 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.35 
 
 		 565 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  23.11 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  24.28 
 
 		 553 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  25.8 
 
 		 548 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.49 
 
 		 550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  24.22 
 
 		 532 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.14 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  25.21 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  23.24 
 
 		 568 aa  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.93 
 
 		 543 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  22.7 
 
 		 542 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  21.81 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  25 
 
 		 544 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 539 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  25.1 
 
 		 537 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.3 
 
 		 544 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  23.25 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  22.48 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  23.54 
 
 		 619 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  27.23 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  24.01 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.88 
 
 		 504 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  22.77 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  25.4 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  21.77 
 
 		 530 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  22.32 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.75 
 
 		 506 aa  100  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  22.67 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  24.77 
 
 		 518 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  21.26 
 
 		 540 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  23.81 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  23.06 
 
 		 556 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 520 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  22.76 
 
 		 522 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  24.02 
 
 		 557 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  22.57 
 
 		 554 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  23.03 
 
 		 559 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  22.83 
 
 		 536 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  23.68 
 
 		 552 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  23.31 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  22.92 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  24.13 
 
 		 508 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 513 aa  92.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  23.25 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  23.58 
 
 		 525 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  21.94 
 
 		 535 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  21.04 
 
 		 484 aa  90.9  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  22.73 
 
 		 565 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  21.14 
 
 		 538 aa  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  21.43 
 
 		 536 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  21.2 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  24.45 
 
 		 596 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  22 
 
 		 540 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.77 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  20.41 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  22.02 
 
 		 539 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  23.08 
 
 		 541 aa  86.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  22.39 
 
 		 579 aa  86.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  22.06 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  21.54 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.03 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  25.44 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.18 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  21.25 
 
 		 576 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  24.05 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.83 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  21.59 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  21.58 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  23.47 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  23.34 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  22.24 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  21.56 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  21.85 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  21.59 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>