272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1394 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  100 
 
 
484 aa  986    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  46.52 
 
 
492 aa  350  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  46.24 
 
 
505 aa  347  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  46.64 
 
 
536 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3965  amidohydrolase 3  44.42 
 
 
509 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  42.42 
 
 
506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  41.12 
 
 
508 aa  290  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  42.12 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  36.34 
 
 
513 aa  271  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  40.6 
 
 
504 aa  243  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.26 
 
 
543 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.86 
 
 
532 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.82 
 
 
530 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.55 
 
 
522 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.59 
 
 
527 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.58 
 
 
568 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.68 
 
 
556 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.16 
 
 
556 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.12 
 
 
546 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.4 
 
 
553 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27 
 
 
550 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  28.71 
 
 
554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  29.92 
 
 
540 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.59 
 
 
557 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.79 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.06 
 
 
583 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.31 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.2 
 
 
543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.4 
 
 
537 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.6 
 
 
619 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.32 
 
 
544 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.35 
 
 
522 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  31.35 
 
 
501 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.73 
 
 
542 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.35 
 
 
522 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.72 
 
 
565 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.15 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.75 
 
 
533 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.15 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.14 
 
 
548 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.15 
 
 
522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.46 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.25 
 
 
552 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.35 
 
 
539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.86 
 
 
542 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  24.4 
 
 
452 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.39 
 
 
522 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.9 
 
 
560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  23.89 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.13 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.18 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.41 
 
 
535 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.92 
 
 
574 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.37 
 
 
579 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  28.5 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  22.83 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.51 
 
 
565 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  23.34 
 
 
522 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 
545 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  28.87 
 
 
539 aa  106  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 
522 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.63 
 
 
520 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  29.25 
 
 
512 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  25.85 
 
 
562 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 
548 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.45 
 
 
563 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.21 
 
 
575 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  23.53 
 
 
520 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  27.66 
 
 
537 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.21 
 
 
575 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  28.33 
 
 
538 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  25 
 
 
541 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  26.91 
 
 
565 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  27.16 
 
 
553 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  29.06 
 
 
563 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.63 
 
 
548 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  25.93 
 
 
521 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  24.16 
 
 
541 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  27.13 
 
 
544 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  26.95 
 
 
575 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.89 
 
 
544 aa  97.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  28.73 
 
 
477 aa  97.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  32.18 
 
 
436 aa  96.7  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  25.34 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  32.04 
 
 
548 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  25.34 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  27.15 
 
 
552 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.09 
 
 
549 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  29.09 
 
 
536 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  26.56 
 
 
520 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  24.57 
 
 
560 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  26.41 
 
 
525 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 
549 aa  93.6  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.44 
 
 
505 aa  93.6  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  28.77 
 
 
542 aa  93.6  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.77 
 
 
583 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.96 
 
 
536 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.82 
 
 
543 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  22.72 
 
 
540 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  24.28 
 
 
541 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>