257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4173 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  100 
 
 		 563 aa  1082    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  56.77 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  45.52 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  45 
 
 		 521 aa  363  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  45.69 
 
 		 518 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  47.53 
 
 		 542 aa  359  6e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  45.04 
 
 		 512 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  42.34 
 
 		 552 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  45.32 
 
 		 498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  41.17 
 
 		 551 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  48.52 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  43.17 
 
 		 526 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  42.06 
 
 		 530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  42.06 
 
 		 530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  39.36 
 
 		 558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  42.13 
 
 		 530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  45.77 
 
 		 547 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  41.17 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  39.37 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  40.69 
 
 		 534 aa  292  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  42.28 
 
 		 526 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  42.96 
 
 		 546 aa  276  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  42.16 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  39.15 
 
 		 541 aa  273  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  38.23 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  37.25 
 
 		 541 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.08 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.86 
 
 		 505 aa  156  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.14 
 
 		 540 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 583 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 527 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.76 
 
 		 553 aa  145  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.87 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  27.43 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.01 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 543 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.71 
 
 		 539 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.37 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.16 
 
 		 568 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  29.68 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 553 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 562 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 540 aa  123  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 619 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.32 
 
 		 560 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 548 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.63 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.05 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  31.17 
 
 		 485 aa  117  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.51 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  26.09 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 541 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.64 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 		 584 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.64 
 
 		 575 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  29.65 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 549 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.57 
 
 		 543 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  31.7 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 536 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.57 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.52 
 
 		 548 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.67 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 543 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.31 
 
 		 565 aa  100  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.6 
 
 		 542 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  26.87 
 
 		 542 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.21 
 
 		 522 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 525 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  27.43 
 
 		 535 aa  97.8  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  31.38 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  22.22 
 
 		 563 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  33.47 
 
 		 537 aa  94  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  24.95 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 556 aa  90.9  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.95 
 
 		 539 aa  91.3  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.63 
 
 		 544 aa  90.9  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.16 
 
 		 522 aa  90.5  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.64 
 
 		 540 aa  90.1  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.35 
 
 		 537 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  27.47 
 
 		 538 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 508 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.95 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.36 
 
 		 553 aa  87.8  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  35.29 
 
 		 543 aa  87  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  22.67 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  29.47 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27442  predicted protein  30.63 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.44874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  36.36 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>