More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1873 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  100 
 
 
542 aa  1036    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  58.94 
 
 
539 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  56.25 
 
 
559 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  46.25 
 
 
541 aa  425  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  51.58 
 
 
547 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  47.79 
 
 
552 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  46.03 
 
 
558 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  49.36 
 
 
553 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  47.7 
 
 
518 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  47.98 
 
 
548 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  45.86 
 
 
551 aa  365  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  47.89 
 
 
563 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  45.74 
 
 
530 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  45.74 
 
 
530 aa  346  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  45.56 
 
 
530 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  45.14 
 
 
526 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  46.74 
 
 
546 aa  333  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  46.61 
 
 
526 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  46 
 
 
520 aa  325  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  43.81 
 
 
512 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  43.49 
 
 
521 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  45.56 
 
 
534 aa  317  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  41.79 
 
 
541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  46.76 
 
 
513 aa  296  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  43.07 
 
 
498 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  37.8 
 
 
522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.72 
 
 
520 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.15 
 
 
540 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  26.79 
 
 
505 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.93 
 
 
540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.69 
 
 
583 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.66 
 
 
527 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.96 
 
 
539 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.99 
 
 
530 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
537 aa  135  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.43 
 
 
553 aa  134  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.58 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.6 
 
 
568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25.98 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.76 
 
 
574 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.87 
 
 
556 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.62 
 
 
536 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.24 
 
 
533 aa  123  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.75 
 
 
539 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  32.14 
 
 
536 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.27 
 
 
606 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.69 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.35 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.92 
 
 
532 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.91 
 
 
543 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.84 
 
 
579 aa  118  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.31 
 
 
560 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.02 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.88 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.32 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  26.22 
 
 
546 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.67 
 
 
545 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 
562 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.59 
 
 
543 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.7 
 
 
565 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  25.25 
 
 
513 aa  107  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 
543 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.79 
 
 
583 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.79 
 
 
583 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 
584 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
543 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.65 
 
 
543 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  28.19 
 
 
554 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.46 
 
 
541 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  50 
 
 
266 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  22.56 
 
 
539 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.36 
 
 
583 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30.35 
 
 
499 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.51 
 
 
543 aa  105  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
619 aa  104  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.57 
 
 
542 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  29.72 
 
 
565 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  32.2 
 
 
532 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  31.18 
 
 
544 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
548 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  28.77 
 
 
484 aa  101  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.32 
 
 
563 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.28 
 
 
549 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.05 
 
 
560 aa  100  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.59 
 
 
556 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.12 
 
 
552 aa  100  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 
569 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.15 
 
 
575 aa  98.6  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.46 
 
 
575 aa  97.8  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  28.9 
 
 
555 aa  97.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 
544 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.53 
 
 
527 aa  96.3  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.09 
 
 
620 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  25.42 
 
 
548 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  28.19 
 
 
520 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  28.42 
 
 
555 aa  94  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  29.4 
 
 
525 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25 
 
 
604 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  28.35 
 
 
537 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  28.91 
 
 
536 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>