More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1776 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  100 
 
 
559 aa  1075    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  56.25 
 
 
542 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  56.07 
 
 
539 aa  521  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  44.39 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  42.75 
 
 
558 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  43.99 
 
 
551 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  43.65 
 
 
518 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  45.37 
 
 
546 aa  334  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  41.68 
 
 
552 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  43.65 
 
 
548 aa  329  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  44.93 
 
 
547 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  43.06 
 
 
521 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  41.28 
 
 
553 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  39.86 
 
 
512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  42.34 
 
 
526 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  41.08 
 
 
530 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  41.08 
 
 
530 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  40.9 
 
 
530 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  42.04 
 
 
526 aa  299  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  42.16 
 
 
498 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  39.29 
 
 
563 aa  283  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  40.93 
 
 
520 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  39.22 
 
 
541 aa  280  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  39.15 
 
 
534 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  40.74 
 
 
513 aa  263  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.64 
 
 
522 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.44 
 
 
520 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.22 
 
 
540 aa  173  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  27.74 
 
 
505 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.45 
 
 
583 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.33 
 
 
562 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  31.89 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.33 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 
527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.99 
 
 
543 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.36 
 
 
540 aa  127  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  29.63 
 
 
537 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.36 
 
 
539 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  24.35 
 
 
452 aa  124  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.43 
 
 
537 aa  123  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.1 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.86 
 
 
532 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.22 
 
 
553 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.96 
 
 
530 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.96 
 
 
565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.53 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.59 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.92 
 
 
556 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.7 
 
 
543 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  27.94 
 
 
568 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.55 
 
 
569 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.61 
 
 
541 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.82 
 
 
544 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  24.41 
 
 
553 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.13 
 
 
579 aa  107  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.28 
 
 
543 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.09 
 
 
543 aa  104  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.78 
 
 
574 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.14 
 
 
546 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.93 
 
 
560 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 
513 aa  101  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  27.84 
 
 
552 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  26.04 
 
 
604 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.7 
 
 
556 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  26.65 
 
 
554 aa  99  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  29.35 
 
 
545 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  27.71 
 
 
565 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  23.03 
 
 
435 aa  96.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.84 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.45 
 
 
538 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.1 
 
 
543 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  25.58 
 
 
580 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.4 
 
 
606 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  26.87 
 
 
547 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  24.49 
 
 
544 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.52 
 
 
545 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  29.8 
 
 
505 aa  94  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.81 
 
 
541 aa  93.6  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.81 
 
 
538 aa  93.6  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  24.5 
 
 
541 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.37 
 
 
564 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  22.09 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  26.63 
 
 
555 aa  93.2  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  26.26 
 
 
522 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  25.17 
 
 
601 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.08 
 
 
550 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  26.33 
 
 
580 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  26.84 
 
 
552 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  25.85 
 
 
549 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  24.59 
 
 
548 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  27.52 
 
 
484 aa  90.5  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  21.9 
 
 
522 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.06 
 
 
542 aa  90.1  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  21.71 
 
 
522 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  30.98 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  24.96 
 
 
585 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.05 
 
 
564 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.37 
 
 
525 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 
584 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.49 
 
 
506 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>