295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2702 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 513 aa  973    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  51.94 
 
 		 552 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  49.46 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  48.71 
 
 		 521 aa  362  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  50.43 
 
 		 518 aa  359  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  48.71 
 
 		 498 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  49.89 
 
 		 548 aa  346  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  50.64 
 
 		 530 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  50.64 
 
 		 530 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  50.97 
 
 		 530 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  48.52 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  49.16 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  43.47 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  48.7 
 
 		 534 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  47.07 
 
 		 542 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  48.5 
 
 		 526 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  40.77 
 
 		 558 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  43.23 
 
 		 551 aa  286  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  47 
 
 		 546 aa  286  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  43.75 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  40.94 
 
 		 559 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  45.49 
 
 		 520 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.07 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  45.65 
 
 		 547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  42.26 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  38.63 
 
 		 541 aa  258  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.79 
 
 		 520 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  35.58 
 
 		 540 aa  196  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.6 
 
 		 505 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.53 
 
 		 539 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 583 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.88 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 579 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 553 aa  146  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 550 aa  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.77 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.42 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.13 
 
 		 530 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.51 
 
 		 619 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.98 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.58 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.77 
 
 		 548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.51 
 
 		 543 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.47 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  23.9 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.69 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.11 
 
 		 565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.5 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.26 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.39 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.72 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 543 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 556 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 539 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.96 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  30.77 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.69 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  32.3 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.55 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.43 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  32.94 
 
 		 565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  23.98 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  23.98 
 
 		 522 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  23.78 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  23.78 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 553 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.37 
 
 		 537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  26.42 
 
 		 541 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30 
 
 		 499 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  30.95 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.27 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  23.53 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25 
 
 		 552 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.96 
 
 		 543 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.78 
 
 		 548 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.17 
 
 		 543 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  32.17 
 
 		 508 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.66 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.06 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.73 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  34.32 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  27.73 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.06 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  31.75 
 
 		 538 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.77 
 
 		 569 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.07 
 
 		 551 aa  100  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.53 
 
 		 537 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.39 
 
 		 506 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 589 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.08 
 
 		 549 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>