281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3116 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  69.91 
 
 		 534 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  76.17 
 
 		 530 aa  715    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  76.17 
 
 		 530 aa  715    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  79.09 
 
 		 526 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  76.17 
 
 		 530 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  100 
 
 		 526 aa  1027    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  57.76 
 
 		 518 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  58.85 
 
 		 552 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  56.03 
 
 		 541 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  57.36 
 
 		 520 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  50 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  50.28 
 
 		 546 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  45.96 
 
 		 558 aa  389  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  48.69 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  45.72 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  45.74 
 
 		 521 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  45.32 
 
 		 542 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  47.22 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  44.51 
 
 		 539 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  42.04 
 
 		 559 aa  340  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  42.15 
 
 		 541 aa  336  5.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  47.08 
 
 		 547 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  41.59 
 
 		 563 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  47 
 
 		 513 aa  322  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  42.51 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  35.94 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.16 
 
 		 540 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.43 
 
 		 520 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.33 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.16 
 
 		 553 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 556 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.13 
 
 		 543 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.08 
 
 		 583 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.52 
 
 		 568 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.75 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  22.27 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 543 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 532 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 562 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.72 
 
 		 527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  26.56 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.25 
 
 		 560 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  22.46 
 
 		 522 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  24.27 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  32.07 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  22.27 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.13 
 
 		 544 aa  115  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  21.09 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.91 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.28 
 
 		 574 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  26.74 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  22.35 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  22.07 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.6 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  21.88 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.49 
 
 		 544 aa  110  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 545 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  21.74 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  21.88 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  21.48 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.94 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  21.48 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  21.68 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.05 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 549 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24 
 
 		 552 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 537 aa  104  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  21.66 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.05 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.44 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  25.84 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  24.69 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  24.08 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 536 aa  101  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  26.74 
 
 		 542 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  27.65 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 552 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  28.69 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.1 
 
 		 579 aa  100  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  30.86 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 475 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  24.15 
 
 		 557 aa  98.6  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  24.28 
 
 		 619 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 551 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.9 
 
 		 538 aa  97.4  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 556 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  21.19 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.29 
 
 		 550 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  47.2 
 
 		 266 aa  95.1  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  25.78 
 
 		 542 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>