27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  517  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  48.44 
 
 		 558 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  50 
 
 		 542 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  48.82 
 
 		 518 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  45.95 
 
 		 551 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  47.33 
 
 		 539 aa  98.6  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  48.48 
 
 		 552 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  48.57 
 
 		 553 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  50 
 
 		 547 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  42.75 
 
 		 559 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  39.68 
 
 		 541 aa  83.2  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  46.46 
 
 		 530 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  46.46 
 
 		 530 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  46.46 
 
 		 530 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  46.4 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  38.35 
 
 		 541 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  46.83 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  43.85 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  47.2 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  43.52 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  43.85 
 
 		 534 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  36.15 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11990  hypothetical protein  40.31 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.340317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  46.67 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  34.83 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  46.67 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  37.36 
 
 		 528 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>