More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2186 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  74.13 
 
 
551 aa  754    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  100 
 
 
558 aa  1114    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  46.32 
 
 
518 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.53 
 
 
552 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  48.71 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  45.7 
 
 
553 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  45.57 
 
 
542 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  45.64 
 
 
539 aa  395  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  41.65 
 
 
559 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  45.54 
 
 
530 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  45.54 
 
 
530 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  45.35 
 
 
530 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  44.49 
 
 
526 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  44.27 
 
 
548 aa  362  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  42.2 
 
 
541 aa  362  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  43.2 
 
 
521 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  45.96 
 
 
526 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  44.69 
 
 
534 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  40.87 
 
 
541 aa  333  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  44.32 
 
 
546 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  43.23 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  42.3 
 
 
520 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  39.34 
 
 
512 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  39.42 
 
 
563 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  37.17 
 
 
522 aa  289  8e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  40.16 
 
 
513 aa  281  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.6 
 
 
520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.78 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.43 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.28 
 
 
505 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.04 
 
 
583 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  28.52 
 
 
540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 
537 aa  140  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.58 
 
 
539 aa  140  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.22 
 
 
532 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
579 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  28.83 
 
 
568 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.27 
 
 
556 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.54 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  29.06 
 
 
539 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.23 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.09 
 
 
533 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.17 
 
 
563 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.88 
 
 
556 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.99 
 
 
552 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  28.51 
 
 
499 aa  123  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.46 
 
 
544 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.29 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.71 
 
 
565 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.07 
 
 
539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.86 
 
 
527 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.41 
 
 
574 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26 
 
 
569 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.82 
 
 
556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.06 
 
 
522 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  29.94 
 
 
554 aa  118  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.61 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  23.88 
 
 
522 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  26.82 
 
 
535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.39 
 
 
520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  24.55 
 
 
541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.75 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.88 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.93 
 
 
583 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.46 
 
 
560 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  28.29 
 
 
565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.65 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.3 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  25.64 
 
 
556 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.33 
 
 
522 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  24.38 
 
 
548 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.38 
 
 
544 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  23.69 
 
 
522 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.36 
 
 
549 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  24.12 
 
 
522 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  28.63 
 
 
485 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  25.67 
 
 
619 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  30.48 
 
 
505 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.04 
 
 
541 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.19 
 
 
553 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.27 
 
 
546 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  23.82 
 
 
522 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  23.73 
 
 
522 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  23.73 
 
 
522 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
475 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  29.93 
 
 
492 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  30.29 
 
 
536 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  25.15 
 
 
522 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.7 
 
 
553 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  29.4 
 
 
525 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  30.95 
 
 
491 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.93 
 
 
544 aa  103  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  48.44 
 
 
266 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  25.79 
 
 
542 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  21.28 
 
 
526 aa  103  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.78 
 
 
548 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.48 
 
 
543 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  25.29 
 
 
541 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  26.87 
 
 
552 aa  103  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>